大家好，所謂科研界自古以來就有一句話：遇事不決，腸道菌群。當(dāng)然，我可能不太懂腸道菌群或者16S測序，但多少懂點孟德爾隨機化，今天我們來看一篇用腸道菌群做暴露，用孟德爾隨機化做方法，5種癌癥為結(jié)局，來評估對癌癥的影響的文章。2023年2月發(fā)表在BMC Medicine上，影響因子11分。

Causal relationship between gut microbiota and cancers: a two-sample Mendelian randomisation study。DOI: 10.1186/s12916-023-02761-6。

看機制圖就能看出來，文章的思路很簡單，暴露患者用的比較新的腸道菌群的GWAS數(shù)據(jù)，其他結(jié)局都是IEU數(shù)據(jù)庫里的，方法就一個，兩樣本孟德爾隨機化，R包也就一個twosampleMR，總的來說就是不復(fù)雜。文章的方法和結(jié)果的闡釋部分還是很值得學(xué)習(xí)的，作者把一些參數(shù)的意義和選擇的目的說的明明白白的，參考文獻也給弄的合情合理，總之值得學(xué)習(xí)。

文章亮點：1.菌群數(shù)據(jù)新，而且分門別類，門、綱、目、科都整理好了，好！2.結(jié)局用了5種癌癥。至于數(shù)據(jù)可以去文章里找。說實話，我不是很喜歡這種啥都研究的泛癌式文章，你作者走別人的路，讓別人無路可走那種。文章也有一些缺點：結(jié)局都是IEU數(shù)據(jù)庫的，有些數(shù)據(jù)比較老了。

真的是一力降十會，大力出奇跡啊。這么簡單的方法，不學(xué)學(xué)？

順便說一句，公眾號后臺接受簡單的咨詢。但是，第一，不要問一些小白的搜索引擎就能搜到的問題！第二，問題比較復(fù)雜的話，可能需要付費，請知悉。