串聯(lián)法和并聯(lián)法構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)

串聯(lián)法(Concatenation)：先將不同物種之間的每個(gè)單拷貝基因單獨(dú)進(jìn)行多序列比對(duì)，然后將這些比對(duì)后的單拷貝基因進(jìn)行首尾相連串接成一個(gè)supergene矩陣，最后將這個(gè)supergene用于構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。

并聯(lián)法(Coalescence)：先將不同物種之間的每個(gè)單拷貝基因單獨(dú)進(jìn)行多序列比對(duì)，并構(gòu)建每一個(gè)單拷貝基因?qū)?yīng)的基因樹(shù)，然后將所有單拷貝基因?qū)?yīng)的基因樹(shù)進(jìn)行合并重構(gòu)出相應(yīng)的物種樹(shù)，再進(jìn)行ML系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的構(gòu)建。