Matrix::readMM包報(bào)Dim_validate錯(cuò)誤

在使用Matrix::readMM讀取10x的mtx文件的時(shí)候，出現(xiàn)一下報(bào)錯(cuò)：

a=Matrix::readMM('matrix.mtx')
Error in isTRUE(r <- .Call(Dim_validate, object, "Matrix")) : 
  object 'Dim_validate' not found

在google上搜索各種問(wèn)題，沒(méi)有找到相關(guān)解決方案，然后再集群的另外一個(gè)R中，缺正常讀取mtx文件，這樣看了，可能是版本兼容性的問(wèn)題，查看另外一個(gè)Matrix包的版本：

#可用Matrix版本
packageVersion('Matrix')
#[1] ‘1.5.3’
#不可用Matrix版本：
packageVersion('Matrix')
#[1] ‘1.6.0’

解決問(wèn)題

發(fā)現(xiàn)兩者版本不一樣，嘗試按照老版本的Matrix包，測(cè)試：

devtools::install_version("Matrix", version ='1.5.3') 
a=Matrix::readMM('matrix.mtx')
a[1:3,1:5]
#3 x 5 sparse Matrix of class "dgTMatrix"
#              
#[1,] . . . . .
#[2,] . . . . .
#[3,] . . . . .

終于解決問(wèn)題，正常讀取mtx文件，通過(guò)此報(bào)錯(cuò)，說(shuō)明R包不一定最新的就合適，新的R包可能與其他的一些包存在一些兼容性問(wèn)題。