dsRNA
dsRNA 即雙鏈RNA , 是由兩條互補(bǔ)鏈復(fù)性形成的RNA 分子,可以被Dicer 酶切割形成siRNA 。
Endo-siRNA
Endo-siRNA 即內(nèi)源性小干擾RNA (siRNA) ,是一類存在于幾乎所有真核生物中的小干擾RNA 分子。
exo-siRNA
exo-siRNA即外源性小干擾RNA (siRNA) ,是指通過體內(nèi)或者體外技術(shù)生成且生物基因組上不編碼,能誘導(dǎo)基因沉默的一類小干擾RNA 分子。病毒感染或者實(shí)驗(yàn)方法導(dǎo)入的雙鏈RNA 可以啟動(dòng)外源性小干擾RNA 的生成。
mi.RNA
mi.RNA 是一類含有約22 個(gè)核苷酸的內(nèi)源性小RNA , 存在于植物和動(dòng)物體內(nèi)。miRNA 由含有70 個(gè)核苷酸的發(fā)夾狀前體經(jīng)Dicer 酶作用而生成, miRNA 可以通過破壞靶mRNA 的穩(wěn)定性、抑制靶mRNA 的翻譯來對靶mRNA 發(fā)揮調(diào)控作用。
piRNA
piRNA 是指piwi 相互作用RNA, 是一類內(nèi)源性小干擾RNA, 能特異性地與動(dòng)物細(xì)胞中Argonaute 蛋白的類似物PIWI 結(jié)合。PiRNA 不能由dsRNA 形成。
RNA 干擾(RNAi)
RNA 干擾是由雙鏈RNA 誘發(fā)的對目的基因表達(dá)的序列特異性沉默作用。
shRNA
shRNA 即小發(fā)夾RNA , 是siRNA 或miRNA 的前體,包含一個(gè)19- 29 個(gè)核苷酸的"莖”和一個(gè)4~15 個(gè)核苷酸的“環(huán)”結(jié)構(gòu)。shRNA 在轉(zhuǎn)錄后可以從細(xì)胞核轉(zhuǎn)移至細(xì)胞質(zhì),在細(xì)胞質(zhì)中其環(huán)結(jié)構(gòu)被Dicer 酶切割, 釋放出siRNA 。shRNA 可以自然生成,也可經(jīng)人工制備并用作基因沉默的工具。
shRNAmir
shRNAmir 即笫二代shRNA, 將siRNA 包裹于自然界生成的pre-miRNA 之中。與標(biāo)準(zhǔn)的shRNA 相比, shRNAmir 對靶mRNA 的沉默效率更高。
siRNA
siRNA 即小干擾RNA , 是一種雙鏈RNA, 長度為21~23 個(gè)核苷酸,其3’端含有兩個(gè)突出的非配對堿基。siRNA 與RISC 結(jié)合后, 一條鏈即信使鏈被移除,另一條鏈即向?qū)ф渼t引導(dǎo)RISC 對互補(bǔ)的靶標(biāo)RNA 分子實(shí)施切割和降解。
saRNA
saRNA即小型激活RNA,也是dsRNA的一種。saRNA具有基因激活功能,能夠上調(diào)目的基因的表達(dá)。