翻譯：黃小偉，資深大數(shù)據(jù)分析從業(yè)者。目前就職杭州有贊數(shù)據(jù)分析團隊!
知乎專欄：中國R語言社區(qū) ｜10000+關(guān)注（Top 1）

2020年7月份，161個R新包收錄于CRAN(2020年6月份收錄290個)，累計收錄17,057個R包！由于CRAN會不定時進行R包增刪，所以具體數(shù)量會隨時間略有變化。此次整理了七個類別，分別為計算方法、數(shù)據(jù)、基因組學(xué)、機器學(xué)習(xí)、科學(xué)、統(tǒng)計學(xué)、效率工具。以下是本期（總第44期）R新包的核心功能介紹：

一. 計算方法

1. libgeos: 提供API接口訪問開源幾何引擎GEOS，它可以用來編寫高性能的C和C++幾何運算.
2. gms: 提供一系列工具，支持創(chuàng)建和維護以GAMSmodeling語言編寫的模塊化模型.
3. LoopDetectR: 提供檢測常微分方程（ODE）模型中物種（節(jié)點）之間反饋回路（循環(huán)、電路）的函數(shù).
4. mrgsim.parallel: 為mrgsolve ODE解算器提供并行后端.
5. paropt: 使用SUNDIALS套件的單線性微分/代數(shù)方程求解器來優(yōu)化常微分方程參數(shù).

二. 數(shù)據(jù)

1. chirps: 使用站CHIRPS數(shù)據(jù)：35年以上的衛(wèi)星圖像、以及用于創(chuàng)建柵格化降雨時間序列以用于趨勢分析和季節(jié)性干旱監(jiān)測的現(xiàn)場災(zāi)害數(shù)據(jù)，為氣候危害小組的紅外降水實現(xiàn)API端口.

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2. covid19mobility: 提供COVID-19變化數(shù)據(jù)，這些數(shù)據(jù)來自不同來源，包括谷歌、蘋果和其他公司.

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3. covidregionaldata: 提供每日COVID-19時間序列數(shù)據(jù)的訪問，包括幾個主要國家和地區(qū)的病例、死亡、住院和測試.

4. fec16: 提供對聯(lián)邦選舉委員會報告的美國2016年聯(lián)邦選舉周期的相關(guān)數(shù)據(jù)的訪問，包括候選人、委員會和各種不同財政支出的信息.

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5. oxcovid19: 提供到OxCOVID19數(shù)據(jù)庫的API接口.6. palmerpenguins: 提供在南極洲帕爾默站附近的帕爾默群島的島嶼上觀察到的成年覓食阿黛麗、欽斯特拉和巴布亞企鵝的尺寸測量、觀察數(shù)據(jù).

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三. 基因組學(xué)

1. bioseq: 提供一個工具箱，用于操作DNA、RNA和氨基酸序列，進行檢測、選擇、替換、轉(zhuǎn)錄和翻譯等操作.

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2. singleCellHaystack:實現(xiàn)Vandenbon&Diez（2019）中描述的singleCellHaystack算法，用于在單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn)差異表達的基因.

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四. 機器學(xué)習(xí)

1. image.binarization: 通過對圖像進行二值化（將彩色或灰度圖像轉(zhuǎn)換為黑白圖像）來實現(xiàn)改進光學(xué)字符識別的算法.

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2. image.ContourDetector: 實現(xiàn)了von Gioi＆Randall（2016）中描述的無監(jiān)督平滑輪廓檢測算法.

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3. image.CornerDetectionF9: 實現(xiàn)Rosten等人解釋的FAST-9拐角檢測算法.4. image.CornerDetectionHarris: 實現(xiàn)Sánchez等人（2018）中描述的Harris角點檢測算法.

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5. image.LineSegmentDetector:實現(xiàn)von Gioi等人（2012）中描述的線段檢測器算法.

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6. freqtables: 提供功能以創(chuàng)建用于分類變量的描述性統(tǒng)計表（即計數(shù)、百分比、置信區(qū)間等）.

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7. nbTransmission: 提供功能來估計傳染病暴發(fā)之間病例之間的相對傳播概率.

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8. precautionary: 通過添加診斷程序以根據(jù)藥代動力學(xué)和藥效學(xué)的預(yù)期個體差異來提供功能來增強1期劑量遞增試驗的設(shè)計和仿真的功能.

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9. pspline.inference: 提供了使用帶懲罰基樣條（P-樣條）的廣義加性（混合）模型推斷傳染病結(jié)果的工具.
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10. SITH: 實現(xiàn)了一個癌癥生長和突變的三維隨機模型，類似于Waclaw等人描述的模型，并允許交互式三維可視化模擬腫瘤.

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五. 科學(xué)

1. apsimx: 提高農(nóng)業(yè)系統(tǒng)建模和仿真的APSIM框架的接口 .
2. cmstatr: 實現(xiàn)航空航天應(yīng)用中高級復(fù)合材料常用的統(tǒng)計方法，重點是計算材料強度特性的基礎(chǔ)值（下公差界限），以及執(zhí)行相關(guān)的診斷測試.

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3. hadron: 提供了一個工具包，用于對從萊迪思蒙特卡洛模擬生成的相關(guān)函數(shù)進行統(tǒng)計分析，包括從格形量子色動力學(xué)模擬中提取強子量的功能，以確定強子態(tài)的能量本征值.
4. sarp.snowprofile: 提供分析和繪圖工具，用于從手動積雪觀測和實際積雪模型產(chǎn)生的積雪剖面數(shù)據(jù)分析.

六. 統(tǒng)計學(xué)

1. fddm: 實現(xiàn)了具有空間可變漂移率的Ratcliff＆McKoon（2008）的擴散決策模型。它包括Navarro＆Fuss和Gondan等人的近似C ++實現(xiàn).2. GGMncv: 提供函數(shù)來估計具有非凸懲罰的高斯圖形模型.

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3. LTRCforests: 實現(xiàn)條件推理森林和隨機生存森林算法，以使用時不變協(xié)變量對左截斷的右刪失數(shù)據(jù)建模，并使用時變協(xié)變量對（左刪減的）右刪失生存數(shù)據(jù)建模.
4. MoMPCA:實現(xiàn)一種方法，用固定數(shù)量的變量（如文檔/術(shù)語矩陣）對任何計數(shù)數(shù)據(jù)矩陣進行聚類.

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5. nortsTest:實施了Lobato和Velasco、Epps、Psaradakis和Vavra四個測試，以及評估平穩(wěn)過程正態(tài)性的隨機投影測試.

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6. sptotal: 提供使用Ver Hoef（2008）中的方法預(yù)測空間數(shù)據(jù)上的總數(shù)和加權(quán)總和或有限總體塊克里金法的功能.

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7. ztpln: 提供用于獲取零截斷泊松對數(shù)正態(tài)分布及其混合分布的密度，隨機變量和最大似然估計的函數(shù).

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七. 效用工具

1. cpp11: 將C ++ 11接口連接到R的C接口，并努力避免C API和C ++異常的跳轉(zhuǎn)，并遵循常規(guī)R函數(shù)的語義并支持與ALTREP向量的交互.

2. listdown: 提供從列表以編程方式創(chuàng)建R Markdown文檔的函數(shù).

3. oysteR: 提供函數(shù)來發(fā)現(xiàn)R包中使用的第三方包，并使用sonatype OSS索引掃描它們是否存在漏洞.

4. rbibutils: 提供在多種書目格式（包括BibTeX、BibLaTeX和Bibentry）之間轉(zhuǎn)換的函數(shù)，并包含Chris Putnam編寫的bibutils實用程序的端口.

5. stickr: 允許用戶下載并使用hex標簽庫中提供的R hex標簽.

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6. supreme: 提供工具以幫助開發(fā)人員可視化和理解Shiny應(yīng)用程序的結(jié)構(gòu).

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說明：限于個人水平，錯誤之處難免，煩請批評指正，共同交流~