線粒體DNA的結(jié)構(gòu)
線粒體的DNA（mitogenome）是獨(dú)立于細(xì)胞核染色體之外的基因組，它具有獨(dú)立的自我復(fù)制，轉(zhuǎn)錄和編碼的功能。一般中的線粒體基因組較小，為10-39kb，酵母為8-80kb；都是環(huán)狀；植物的線粒體基因組比動物的大許多，但也復(fù)雜的多，大小可以從200-2500kb。
以人的線粒體為例，有16,569bp組成，雙鏈閉合的環(huán)狀結(jié)構(gòu)，其中外鏈DNA單鏈由于G多C少，使得整個外鏈的DNA分子量較大，陳偉重鏈（heavy chain）或者H鏈；內(nèi)環(huán)的單鏈C含量高，G含量少，稱為輕鏈（light chain）或者L鏈。
線粒體的基因組中沒有內(nèi)含子序列，編碼的基因有重疊的現(xiàn)象。
線粒體DNA的組成
線粒體DNA有37個基因組成，其中包括兩個rRNA基因（rrnL,rrnS)，13個編碼蛋白質(zhì)的基因，還有22個tRNA基因。
這里著重說一下CO1基因吧，也寫做COX1，這個基因由于具有物種特異性，又相對的比較保守，一般被用作barcode，用于鑒定物種。
111.jpg
線粒體中還有一個D loop區(qū)域，這個區(qū)域沒有編碼區(qū)，也是變異最大的區(qū)域，這個區(qū)域我查了很多資料，都沒有特別的結(jié)構(gòu)上的定義，不過好在可以將組裝好的線粒體基因組上傳到MITOS2網(wǎng)站 http://mitos.bioinf.uni-leipzig.de/index.py，它可以幫你分析這個D loop 區(qū)域的范圍。
Reference:
https://wenku.baidu.com/view/08f89178eef9aef8941ea76e58fafab068dc441c.html
https://baike.baidu.com/item/%E7%BA%BF%E7%B2%92%E4%BD%93DNA/4101125?fr=aladdin
