最近這幾天在學(xué)習(xí)用R語言完成主成分分析,印象里在公眾號分享的文章里看到過可視化主成分分析結(jié)果的包,通過微信的搜索功能找到了公眾號 宏基因組 分享的文章?ggbioplot-最好看的PCA作圖。簡單記錄一下自己的重復(fù)過程,通過help()函數(shù)查看幫助文檔help(package="ggbiplot")可以看到這個包共有兩個函數(shù)ggbiplot()和ggscreeplot()和一個數(shù)據(jù)集wine
幫助文檔中的例子代碼


幫助文檔代碼運(yùn)行結(jié)果圖

用biplot()函數(shù)繪制的結(jié)果圖
第二幅圖相對于第三幅確實(shí)美化很多,而且ggbiplot()函數(shù)還有和多參數(shù),應(yīng)該可以調(diào)整一下細(xì)節(jié)是結(jié)果更加美化
ggord包可以添加置信區(qū)間,通過install_github()包安裝install_github("fawda123/ggord")
就簡單記錄到這里吧,明天仔細(xì)研究一下主成分分析的過程及意義