PSI值：（再翻墻找一下答案）

PSI ( Percent-spliced-in，拼接百分比)可以針對(duì)isoform, exon,

ASE

進(jìn)行計(jì)算，對(duì)于ASE來(lái)說(shuō)， PSI = splice_in / (splice_in

+splice_out),

在RNA-seq 數(shù)據(jù)中splice_in 和splice_out分別是支持

splice in 和splice out 發(fā)生的reads的數(shù)目

PSI模式圖

剪接因子：

SF(剪接因子， splicing factor)參與RNA前體剪切過(guò)程的蛋白質(zhì)因子。根據(jù)其功能作用，可以分為核小核糖核蛋白顆粒(snRNP)蛋白因子和非snRNP蛋白因子。

可變剪接表達(dá)矩陣的過(guò)濾和補(bǔ)缺？

1.低表達(dá)量過(guò)濾（PSI值接近于0的）2.標(biāo)準(zhǔn)差過(guò)濾（表達(dá)差異?。?/p>

繪制7個(gè)氣泡圖（7種可變剪接事件）

lasso回歸：篩選相關(guān)性高的基因

第一個(gè)視頻28min：lasso回歸圖的意義

生存分析：按照中位值將病人分為高低風(fēng)險(xiǎn)兩組

繪制7個(gè)ROC曲線

P25：熱圖表示可變剪接基因是高風(fēng)險(xiǎn)基因還是低風(fēng)險(xiǎn)基因

提取SF的表達(dá)量，然后可以做AS事件和SF表達(dá)量的分析，最后繪制調(diào)控網(wǎng)絡(luò)