中國(guó)科學(xué)院遺傳發(fā)育所 生物信息學(xué)博士<br>專注于基因組組裝和群體重測(cè)序研究
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：福建
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大家好，我叫楊俊偉，現(xiàn)就讀于中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)，在讀博士，主要從事生物信息學(xué)方面工作。<br><br>人生格言：Take pains, be perfect
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在線工具網(wǎng)站，生物分析的一些網(wǎng)站或者數(shù)據(jù)庫(kù)之類的文章。??相關(guān)的文章會(huì)在收錄時(shí)間上相近，請(qǐng)點(diǎn)擊『最新收錄』 ?????????????????????????? ?? 數(shù)據(jù)庫(kù)，比如Ensembl、Phytome ?? 癌癥分析網(wǎng)站，比如GEPIA、cBioportal ?? 系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的美化，比如iTOL ?? 基因注釋，比如Metascape、KASS ?? 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)，比如pfam、SMART ?? 在線繪制統(tǒng)計(jì)圖，比如Venny ?? 序列比對(duì)，比如blast ?? 引物設(shè)計(jì)，比如primer3、primer-blast ?? 文獻(xiàn)下載，比如sci-hub，文獻(xiàn)鳥(niǎo) ?? 。。。
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一些生物信息學(xué)用到的軟件，工具，介紹用法安裝以及以及應(yīng)用的文章 ?? 測(cè)序組裝使用的Spades、canu等等 ?? 序列比對(duì)比如blast、bowtie、diamond等 ?? 多序列比對(duì)比如mega、clustalW、matff等 ?? 序列格式轉(zhuǎn)化的samtools、bedtools等等 ?? 可變剪接分析的rMATS、MISO ?? 微衛(wèi)星序列查找工具misa等 ?? call peak的工具macs2 ?? 文獻(xiàn)下載工具Sci-hub桌面版 ?? 進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建工具IQtree、ggtree等 ?? 同源基因查找工具OrthoMCL、OrthoFinder等 ?? 尋找測(cè)序中的結(jié)構(gòu)變異或者SNP序列GATK、bcftools等 ?? 宏基因組組裝與分析的anvi'o、QIMME ?? 測(cè)序質(zhì)量評(píng)估的FastQC、BUSCO、QUAST ?? 可視化工具比如IGV、3D Genome ?? 測(cè)序數(shù)據(jù)下載工具SRA Toolkit、ascp等 ?? 數(shù)據(jù)可視化的工具circos 等等
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我要偷偷內(nèi)卷，然后驚艷所有人！
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南京櫻花大學(xué)<br>
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從數(shù)碼發(fā)燒友到酷玩評(píng)測(cè)人，筆點(diǎn)君一直在路上。<br>微博及自媒體：筆點(diǎn)酷玩；<br>微信：bidiankuwan，歡迎交流提問(wèn)。
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嘗試不會(huì)有失敗，頂多是知道此路不通而已。
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