@Usefulless阿吉 我用了4.1.3版本的R，就可以了
【轉(zhuǎn)】Reading KEGG annotation online: fail to download KEGG data... Error in download.KEGG.Path(spe...本文轉(zhuǎn)載自：http://www.360doc.com/content/22/0604/23/76149697_1034565139.shtml 最近在做KEGG富集分析時(shí)，...
只需要加載這一個(gè)包嗎？為什么我還是不行
用clusterProfiler包進(jìn)行KEGG富集分析遇到Error記錄按照標(biāo)準(zhǔn)流程對(duì)GEO上下的數(shù)據(jù)進(jìn)行數(shù)據(jù)處理，差異分析，富集分析到enrichKEGG的這一步的時(shí)候就出現(xiàn)了Error。 ekegg <- enrichKEGG(diff_ge...
只需要加載這一個(gè)包嗎？為什么我還是不行，試了好多次了??
用clusterProfiler包進(jìn)行KEGG富集分析遇到Error記錄按照標(biāo)準(zhǔn)流程對(duì)GEO上下的數(shù)據(jù)進(jìn)行數(shù)據(jù)處理，差異分析，富集分析到enrichKEGG的這一步的時(shí)候就出現(xiàn)了Error。 ekegg <- enrichKEGG(diff_ge...
@七樓的白羊 剛問了一個(gè)做生信的幫我這樣改，
BiocManager::install("clusterProfiler",force = T)
library("clusterProfiler")
library("org.Hs.eg.db")
getOption("clusterProfiler.download.method")
options(clusterProfiler.download.method = "wininet")
但在他那里可以在我這里還是同樣報(bào)錯(cuò)，是運(yùn)行順序的問題還是我數(shù)據(jù)的問題呢
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@逍遙小小圣 hhh好啊好啊，我各種試也不行
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@逍遙小小圣 沒有呢，哭了哭了
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@七樓的白羊 @七樓的白羊 我試了一下也不行，在安裝R。utils時(shí)一直需要更新，如果更新了結(jié)果就是沒有g(shù)seKEGG函數(shù)，沒更新就還是報(bào)錯(cuò)
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