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DISEASES | 周更的基因-疾病關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)庫寫在前面 https://diseases.jensenlab.org/SearchDISEASES 每周更新，它集成了來自自動(dòng)文本挖掘、手工整理的文獻(xiàn)、癌癥突變數(shù)據(jù)和全基因...
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MD5檢驗(yàn)
在傳輸較大數(shù)據(jù)的時(shí)候，常常需要在Linux中進(jìn)行文件的MD5校驗(yàn)。如測(cè)序數(shù)據(jù)幾十G，單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)幾百G的矩陣，如果傳輸數(shù)據(jù)不完整，則MD5碼是不一樣的。文件較少的情況可以直...
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繪制 SNP 密度圖一般使用 CMplot 繪制SNP密度圖：包鏈接：https://github.com/YinLiLin/R-CMplot 要繪制 SNP 密度圖，僅僅需要三列即可：a. 第...
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專注機(jī)器學(xué)習(xí)和數(shù)據(jù)分析，Python、R、Ruby、MATLAB、Mathematica。
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生信學(xué)習(xí)筆記、腳本編程、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、數(shù)據(jù)分析 ～～～ 生物信息領(lǐng)域的大雜燴～ 好大一鍋亂燉，快到我的額碗里來～ 好好學(xué)習(xí)，天天學(xué)生信～
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收集一些生物信息學(xué)的分析流程的文章。感謝這些簡(jiǎn)友整理的生信分析流程！ 如果簡(jiǎn)友投稿沒有被我收入專題，可能是我沒看到或者收入到其他針對(duì)性更強(qiáng)的專題中了。望見諒！ ???????????????????????? 文章的收錄是有順序的，查看的時(shí)候請(qǐng)點(diǎn)擊“最新收錄”然后進(jìn)行查看。 ?? 全基因組測(cè)序(WGS)分析 ?? 轉(zhuǎn)錄組分析RNA-seq的分析流程 ?? 染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)ATAC-Seq、ChIP-Seq分析 ?? 單細(xì)胞scRNA-seq分析 ?? 癌癥的預(yù)后標(biāo)志物查找 ?? 系統(tǒng)發(fā)育演化進(jìn)化樹構(gòu)建與分析 ?? 群體遺傳學(xué)分析 ?? 全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS) ?? 基因家族的分析 ?? 甲基化測(cè)序與分析 ?? KEGG/GO功能富集分析 ?? 圖形繪制具體細(xì)節(jié)的比如熱圖、曼哈頓圖的繪制等 ?? python、perl、R的包的使用過程 ?? 具體工具的使用，比如GATK的使用過程 ?? 數(shù)據(jù)庫的挖掘方法，比如TCGA數(shù)據(jù)庫的使用 ?? 另外就是整個(gè)文章走下來的流程 ?? ?? ??
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周運(yùn)來，男，長大了才會(huì)遇到的帥哥，穩(wěn)健，瀟灑，大方，靠譜。一段生信緣，一棵技能樹。生信技能樹核心成員，單細(xì)胞天地供稿人，簡(jiǎn)書創(chuàng)作者，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家。
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10X單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組多物種聯(lián)合分析：以人和小鼠為例10X單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組是可以聯(lián)合分析多個(gè)物種的。也許，你會(huì)問為什么要分析多個(gè)物種，我一個(gè)物種的某個(gè)器官還整明白呢？其實(shí)在做： 模型 移植 免疫 病毒 生殖隔離 的時(shí)候，同一個(gè)組織...
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我的生信自學(xué)心得分享
這是我2022-02-16在CGM分享的文字稿 從2016年，我開始自學(xué)生物信息，那個(gè)時(shí)候，為了加深自己學(xué)習(xí)，所以就不間斷的在網(wǎng)上分享我的學(xué)習(xí)筆記。 我有一個(gè)自己的博客，xu...
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個(gè)人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
