發(fā)簡信
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生信算法||新算法，soScope結(jié)合多模態(tài)數(shù)據(jù)進(jìn)行空間分辨率增強(qiáng)空間轉(zhuǎn)錄組結(jié)合多模態(tài)數(shù)據(jù)進(jìn)行空間數(shù)據(jù)分析正在成為熱點(diǎn)，包括昨天剛介紹的METI和今天的文章。 近日，《Nature Communications...
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生信算法||新算法，METI結(jié)合HE圖像深入研究TME近日，《Nature Communications》發(fā)表了一篇關(guān)于空間轉(zhuǎn)錄組腫瘤微環(huán)境研究的創(chuàng)新性的算法（形態(tài)增強(qiáng)型空間轉(zhuǎn)錄組分析集成器（MET...
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R語言||干貨！tidyverse包-數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換dplyr包進(jìn)階R-tidyverse包-數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換dplyr包進(jìn)階 R語言||干貨！tidyverse包-數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換dplyr包進(jìn)階 目錄 [TOC] 簡介 Dp...
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文獻(xiàn)速遞||cell2location軟件聯(lián)合單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行空間轉(zhuǎn)錄組細(xì)胞映射同名gzh：BBio //前言 對空間轉(zhuǎn)錄組的組織駐留細(xì)胞類型的復(fù)雜映射仍然是一個挑戰(zhàn)。原因之一是器官間細(xì)胞的巨大多樣性，包括無數(shù)細(xì)粒細(xì)胞類型，...
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R語言||rstatix包和ggpubr包復(fù)現(xiàn)標(biāo)注統(tǒng)計檢驗(yàn)顯著性的各種花樣的圖形同名公主號：BBio rstatix包支持管道符，與tidyverse包設(shè)計理念相一致，用于執(zhí)行基本的統(tǒng)計檢驗(yàn)，包括t檢驗(yàn)、Wilcoxon檢驗(yàn)...
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R語言||reshape2包在長寬數(shù)據(jù)格式轉(zhuǎn)換中的用法
同名公主號：BBio reshape2包最常用的場景就是長數(shù)據(jù)和寬數(shù)據(jù)的轉(zhuǎn)換，兩個函數(shù)即可搞定。作者也是tidyverse的作者，Rstudio...
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R語言||最豐富的數(shù)據(jù)清洗工具tidyverse包同名公主號：BBio tidyverse包實(shí)際上就是一些常用R包的集合，包括ggplot2（可視化）、dplyr（數(shù)據(jù)操作）、tidyr（數(shù)據(jù)）...
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文獻(xiàn)速遞||空間轉(zhuǎn)錄組-時空組學(xué)聯(lián)盟4篇Stereo-seq模式物種文章歡迎關(guān)注同名公主號：BBio 2020年《Nature Methods》雜志將空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)評選為Method of the year，時至今日，...
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分析流程||Seurat空間轉(zhuǎn)錄組分析流程歡迎關(guān)注同名公主號：BBio 流程包括單切片的基本分析、scRNA整合、多切片整合。 參考：https://satijalab.org/seur...