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  • @leoxiaobei 老師,nlstools::confint2獲得置信區(qū)間,只能得出一組的和difference的置信區(qū)間,另一組的置信區(qū)間應(yīng)該如何獲得呢?

    生物節(jié)律之cosinor分析——終極R包c(diǎn)ircacompare(5)

    前面我們已經(jīng)介紹了cosinor差異分析最常用的兩個(gè)包:cosinor和cosinor2包,這兩個(gè)包其實(shí)已經(jīng)做得非常好了,就是還有一點(diǎn)點(diǎn)缺陷,下面一起來看看它們的缺陷: 1....

  • 老師,您好。請(qǐng)問一下作出來的圖沒有顯示余弦曲線,也提示 Data is arrhythmic,但是仍然給出了mesor,amplitude和peak time三個(gè)值,那這三個(gè)值還有意義嗎?

    生物節(jié)律之cosinor分析——終極R包c(diǎn)ircacompare(5)

    前面我們已經(jīng)介紹了cosinor差異分析最常用的兩個(gè)包:cosinor和cosinor2包,這兩個(gè)包其實(shí)已經(jīng)做得非常好了,就是還有一點(diǎn)點(diǎn)缺陷,下面一起來看看它們的缺陷: 1....

  • @千容安 好的,謝謝老師

    基于mRNA表達(dá)表格做信號(hào)通路富集圖

    KEGG Bar plot 以bar的顏色和高度體現(xiàn)enrichment scores(比如pvalue),gene counts或者ratio作為bar Dot plot ...

  • @千容安 請(qǐng)問源數(shù)據(jù)指的是org.Rn.eg.db嗎?應(yīng)該怎么給源數(shù)據(jù)添加SYMBOL列呢?

    基于mRNA表達(dá)表格做信號(hào)通路富集圖

    KEGG Bar plot 以bar的顏色和高度體現(xiàn)enrichment scores(比如pvalue),gene counts或者ratio作為bar Dot plot ...

  • 120
    10X單細(xì)胞(10X空間轉(zhuǎn)錄組)做WGCNA分析的智慧

    hello,大家好,今天給大家分享一些10X單細(xì)胞(10X空間轉(zhuǎn)錄組)做WGCNA分析時(shí)的一些東西,個(gè)人認(rèn)為很重要,不過不得不承認(rèn)的是,10X單細(xì)胞(10X空間轉(zhuǎn)錄組)做WG...

  • 請(qǐng)問在做WGCNA前 基因表達(dá)矩陣 一定要先標(biāo)準(zhǔn)化嗎?用 標(biāo)準(zhǔn)化的 或 未標(biāo)準(zhǔn)化的 基因表達(dá)矩陣 做WGCNA分析有什么差別嗎?

    WGCNA分析

    WGCNA基本概念 加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析 (WGCNA, Weighted correlation network analysis)是用來描述不同樣品之間基因關(guān)聯(lián)模式的系...

  • phenotypes 是自己制作的,但是 genotypes 文件應(yīng)該如何獲取呢?

    PheWAS(全表型組關(guān)聯(lián)分析)----PheWAS實(shí)戰(zhàn)(三)

    介紹完P(guān)heWAS與GWAS的概念及其對(duì)比以及PheWAS的R包后,相信大家對(duì)對(duì)PheWAS原理以及相關(guān)R包有了初步認(rèn)知。下面我以我做的一個(gè)項(xiàng)目的數(shù)據(jù)為例跑PheWAS。 1...

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