發(fā)簡信
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conda安裝kofamscan
官網(wǎng)的安裝依賴的方法還是有些麻煩，直接用conda安裝！避免報錯~ 下載數(shù)據(jù)庫 安裝環(huán)境 運行
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【效率工具】markdown編輯器
我也不知道這個問題其他小伙伴有沒有碰到過，曾經(jīng)我用Typora好一段長長的文檔，不知道我操作了什么，文檔就變空白了。然后文檔沒辦法恢復，這讓我很...
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【代謝設(shè)計】RetroPathRL逆合成軟件代謝工程的目標是從活的生物體中產(chǎn)生令人感興趣的化學物質(zhì)，從而向更綠色的化學方向發(fā)展。盡管付出了努力，但研究和開發(fā)過程仍然漫長而昂貴，而且需要高效...
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【數(shù)據(jù)庫】RxnFinder
由胡春楠老師團隊開發(fā)的生物合成反應(yīng)數(shù)據(jù)庫（RxnFinder），這個數(shù)據(jù)庫由專門的公司團隊在維護更新。下面是官網(wǎng)介紹： 微生物細胞工廠在生產(chǎn)大宗...
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【數(shù)據(jù)庫】RetroRulesRetroRules是一個代謝途徑發(fā)現(xiàn)和代謝工程的反應(yīng)規(guī)則數(shù)據(jù)庫。反應(yīng)規(guī)則是對反合成工作流程中所使用的反應(yīng)的一般描述，以便枚舉連接目標分子與前體...
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【讀書筆記】《合成生物學》-第一章 合成生物學概述重點：了解合成生物學的產(chǎn)生過程及其工程化特質(zhì)； 難點：理解合成生物學的研究范疇 1.1 合成生物學的起源與發(fā)展 1.1.1 合成生物學的誕生與歷...
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#代謝通路分析工具#
opencobra 開源的基于約束的生物重建、分析和建模的工具（分別在MatLab、python、Julia）。COBRA方法廣泛應(yīng)用于prok...
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#代謝通路設(shè)計# 第一期學習小組分享會-代謝數(shù)據(jù)庫的介紹和使用
第一期學習小組分享會，主題為代謝數(shù)據(jù)庫的介紹和使用，主要內(nèi)容為KEGG、BIGG、MetaCyc、MetaRxn、BRENADA、SEED、AT...