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  • rstudio-server服務(wù)器上一個(gè)用戶的rstudio打不開(kāi)

    方法一 方法二 重啟,也殺不死,怎么辦呢? 主要原因 每一次打開(kāi)RStudio,會(huì)自動(dòng)加載之前的腳本, 并且運(yùn)行, 然后就是死機(jī), 解決問(wèn)題的關(guān)鍵在于刪除臨時(shí)文件。 步驟一:...

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    ID轉(zhuǎn)換

    前面處理步驟之后,行名時(shí)官方格式,轉(zhuǎn)換成對(duì)應(yīng)的genesymble 操作步驟可見(jiàn)下文件夾 title: "基因ID轉(zhuǎn)換"author: "Sun Xiaojie"output...

  • R加載包SeuratData出現(xiàn)invalid multibyte string, element 1報(bào)錯(cuò)

    在加載包SeuratData是遇到了以下報(bào)錯(cuò): 重裝還是不解決問(wèn)題,之前使用也沒(méi)有出現(xiàn)過(guò)報(bào)錯(cuò)。 檢測(cè).libPaths()路徑也是沒(méi)有問(wèn)題的,所以有可能為內(nèi)碼沖突問(wèn)題 在操作...

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    limma的兩個(gè)弟弟:edgeR和DESeq2

    01—研究背景 上一篇公眾號(hào)我們?yōu)榇蠹以敿?xì)的介紹了R軟件包limma篩選差異基因,limma包做差異分析要求數(shù)據(jù)滿足正態(tài)分布或近似正態(tài)分布,如基因芯片、TPM格式的高通量測(cè)序...

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    limma差異分析

    Q:該如何選擇limma, DESeq2, edgeR A:各有各自應(yīng)用的場(chǎng)景 如果是芯片數(shù)據(jù),一般選擇limma,畢竟它是處理芯片數(shù)據(jù)之王。 不過(guò)edgeR也可以。芯片數(shù)據(jù)...

  • Stringtie的使用說(shuō)明

    參考文獻(xiàn):stringtie enables improved reconstruction of a transcriptome from rNA-seq reads幫助文...

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