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制作小麥的GO注釋文件
參考資料：如何獲取GO和KEGG注釋、描述信息[https://zhuanlan.zhihu.com/p/545494092]水稻、小麥GO富集...
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perl語言學(xué)習(xí)系列-----map、grep函數(shù)處理數(shù)組
由于在代碼中經(jīng)常用到foreach循環(huán)遍歷數(shù)組，perl中還存在兩個更為簡單的遍歷數(shù)組的函數(shù)。 1.map函數(shù) a.語法規(guī)則 語法：map EX...
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AgRenSeq一種不依賴參考基因組且能快速克隆R基因的GWAS方法個人總結(jié)：GWAS是復(fù)雜性狀相關(guān)基因定位的常用手段，其結(jié)果與參考基因組的選擇有關(guān)，若多樣性群體中的候選基因不存在于參考基因組，則無法鑒定。而Km...
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qiime2R包整合qiime2和R可視化分析16s數(shù)據(jù)
背景：qiime artifact 是用于存儲qiime2的輸入輸出以及相關(guān)的元數(shù)據(jù)，并提供結(jié)果是如何產(chǎn)生的信息，但是qiime2所產(chǎn)生的art...
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AgRenseq多樣性群體中鑒定、克隆R基因記錄一篇2019年Wulff實(shí)驗(yàn)室發(fā)表在NBT上的一篇關(guān)于R基因克隆方法——AgRenseq的文獻(xiàn)，由于還未吃透，暫做簡單記錄。馴化和快速育種導(dǎo)...
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全基因組水平上NLR pair鑒定
1 NLR pair定義 NLR pair(NLR 功能對)，是在染色體上有著明顯“頭對頭”排列特征，兩個基因協(xié)同調(diào)控免疫反應(yīng)，其中起識別效應(yīng)蛋...
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interproscan linux版本安裝及使用
說明：InterPro[http://www.ebi.ac.uk/interpro/]是一個整合了各種蛋白及其功能的數(shù)據(jù)庫，內(nèi)含有蛋白質(zhì)所屬的家...
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NLR-Annotator工具鑒定NBS-LRR位點(diǎn)一、NLR-Annotator下載及環(huán)境部署 NLR-Annotator 是Steuernagel利用JAVA開發(fā)用以從基因組DNA序列上直接鑒...
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新篇章
本人生信小白一枚，學(xué)生信將近一年時間了，感覺自己學(xué)了個寂寞，老是處在一種“學(xué)了又忘忘了又學(xué)”的狀態(tài)。后來細(xì)細(xì)思考了一番，感覺是自己學(xué)習(xí)方...