您好,大哥,我想跟您請教一個(gè)問題,我用orthofinder去鑒定16個(gè)物種(輪藻,一直到蘋果)的單拷貝基因,但是發(fā)現(xiàn)文件夾里沒有,如果是運(yùn)行4個(gè)基因組,就有單拷貝。是不是基因組越多,單拷貝越少啊,這里,是像您說的,需要參數(shù)過濾嗎?如何過濾呢,我沒找到你的py腳本
Orthofinder2鑒定單拷貝基因并構(gòu)建進(jìn)化樹實(shí)驗(yàn)?zāi)康模罕容^基因組學(xué),從基因組獲取單拷貝基因,并構(gòu)建有根的進(jìn)化樹,并估計(jì)分化時(shí)間,最終畫出有分化時(shí)間的進(jìn)化樹實(shí)驗(yàn)流程:orthofinder2獲取單拷貝基因——muscle...