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  • 你好,是得到的Tassel關(guān)聯(lián)文件直接畫(huà)曼哈頓圖嗎

    GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析流程(BWA+samtools+gatk+Plink+Admixture+Tassel)

    我梳理了GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析的整個(gè)流程,并提供了基本的命令,用到的軟件包括BWA、samtools、gatk、Plink、Admixture、Tassel等,在此分享出來(lái)...

  • 你好,用KO號(hào)查找途徑的時(shí)候 怎么選擇物種

    非模式生物KEGG富集分析

    寫(xiě)在前面 因?yàn)槲已芯康奈锓N比較小眾,很多注釋不完全,R包AnnotationHub中也沒(méi)有對(duì)應(yīng)信息,所以無(wú)法使用公共數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行kegg富集分析。所以自己嘗試使用KAAS造一個(gè)...

  • 您好 你的問(wèn)題解決了嗎

    rMATs的介紹及用法

    具體的介紹和使用方法及原理:使用rmats進(jìn)行可變剪切的分析(摘自生信修煉手冊(cè)) 原理:我理解的原理是他利用了3-4個(gè)外顯子,檢測(cè)哪個(gè)是exon inclusion isof...

  • 您好 b1 后面接的是對(duì)照組的樣本嗎

    rMATS尋找可變剪切

    可變剪切: 軟件: 地址:http://rnaseq-mats.sourceforge.net/user_guide.htm python rmats.py --b1 b1....

  • 您好 請(qǐng)問(wèn)一下哪一步用到表型數(shù)據(jù)了

    跑通GWAS,用這些腳本就夠了

    最近跑通了一遍GWAS分析,全程在linux操作,雖然具體還有好多需要微調(diào)的地方,先把代碼整理分享出來(lái)mark一下 前期準(zhǔn)備 1.理論知識(shí) 強(qiáng)烈推薦百邁客云課堂課程GWAS生...

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