作者,Evil Genius~~ 空間轉(zhuǎn)錄組的運(yùn)用方向:轉(zhuǎn)錄、蛋白 ST最適合回答三種生物問題:首先可以闡明組織的細(xì)胞類型組成;第二類問題與細(xì)胞相互作用有關(guān);最后可以幫助闡明...
作者,Evil Genius~~ 空間轉(zhuǎn)錄組的運(yùn)用方向:轉(zhuǎn)錄、蛋白 ST最適合回答三種生物問題:首先可以闡明組織的細(xì)胞類型組成;第二類問題與細(xì)胞相互作用有關(guān);最后可以幫助闡明...
1. 簡介 MISTy主要有四個功能: 算法:Multi-view framework to dissect effects related to CCI (剖析與細(xì)胞-細(xì)胞...
單細(xì)胞繪圖系列: Seurat繪圖函數(shù)總結(jié)[http://www.itdecent.cn/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2優(yōu)化Seurat繪圖[https...
作者通過整合分析scRNA-seq數(shù)據(jù)、公開發(fā)表的scRNA-seq和bulk RNA-seq數(shù)據(jù)集、空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)、FACS、IF和免疫治療的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),證實(shí)FAP+成纖維...
作者,Evil Genius 這一篇我們繼續(xù)合作項(xiàng)目的分析示例,我們在了解了空間轉(zhuǎn)錄組的整體分析內(nèi)容之后,就需要開始針對我們自己的數(shù)據(jù)進(jìn)行有效分析,注意是有效分析,就是大家分...
簡介 ??目前,單細(xì)胞技術(shù)發(fā)展迅速,單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序可以幫助我們獲得組織中每個細(xì)胞的基因表達(dá)水平,但卻無法獲得對應(yīng)空間位置上的信息??臻g轉(zhuǎn)錄組技術(shù)(spatial trans...
首先附上參考文獻(xiàn):《Spatially informed cell-type deconvolution for spatial transcriptomics》[https...
影響因子:12.4 研究概述:肝癌是全球第三大致癌死亡的原因,也是第六大常見的腫瘤類型。其中,肝細(xì)胞癌(HCC)為最常見的肝癌類型,其次為肝內(nèi)膽管癌(ICC),這兩種類型合計(jì)...