[TOC] 安裝環(huán)境 Ubuntu18.10ART-bin-MountRainier-2016.06.05-Linux64 安裝過程 1、從https://www.niehs...
IP屬地：廣東
-
ART的安裝和簡單使用
-
10X單細胞空間聯(lián)合分析之cell2location的詳細梳理又是周五，馬上元旦，不知道大家打算怎么跨年呢？但是，今天還是工作日，我們還是要學習學習，不負韶華。 這一篇還是想詳細梳理一下cell2location，包括算法以及代碼的寫法...
-
三大經(jīng)典在線生存分析工具測評導讀 在腫瘤相關(guān)研究中，一張精美的生存分析圖，已經(jīng)成了腫瘤研究高分文章的標配。好的臨床預后效果，往往在一定程度上決定了文章發(fā)表的層次。然而對剛剛拿到一個新基因的新手來說，生存...
-
?? Reticulate | 如何在Rstudio中優(yōu)雅地調(diào)用Python！？寫在前面 最近遇到一個大名鼎鼎的包叫Scanpy，用于單細胞測序的分析，不過需要在Python中運行。??于是，我就研究了一下如何在Rstudio中調(diào)用這個神包。 ?? 這里和大...
-
分泌蛋白基因列表下載1. 數(shù)據(jù)下載 在讀Single-Cell Reconstruction of Progression Trajectory Reveals Intervention Pri...
-
SCENIC/pySCENIC結(jié)果可視化 2022-11-08適用背景 之前寫了一篇文章介紹四步完成單細胞數(shù)據(jù)調(diào)控網(wǎng)絡流程分析[http://www.itdecent.cn/p/71ed43163ce1]，但生成的結(jié)果沒有進行可視化，...
-
R 數(shù)據(jù)可視化 —— circlize chordDiagram 高級用法前言 默認風格的 chordDiagram() 已經(jīng)可以滿足大部分需求了，下面我們介紹一些更高級別的圖形配置 使用 1. 軌跡的排布 chordDiagram() 函數(shù)默認會...
-
RNA-seq入門實戰(zhàn)（八）：GSVA——基因集變異分析本節(jié)概覽：1.GSVA簡單介紹2.基因集的下載讀取: 手動與msigdbr包下載3.GSVA的運行4.limma差異分析5.GSVA結(jié)果可視化：熱圖、火山圖、發(fā)散條形圖/柱形...
-
Kaplan-Meier生存分析的結(jié)果解讀和繪制方法1. Kaplan-Meier生存分析 Kaplan Meier是一種單因素生存分析，它可用于研究1個因素對于生存時間的影響。參考：生存分析之Kaplan-Meier曲線都告...
