本文首發(fā)于我的個(gè)人博客， http://xuzhougeng.top/ 往期回顧: 使用ArchR分析單細(xì)胞ATAC-seq數(shù)據(jù)(第一章) 使用ArchR分析單細(xì)胞ATAC-...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：內(nèi)蒙古
-
使用ArchR分析單細(xì)胞ATAC-seq數(shù)據(jù)(第五章) -
單細(xì)胞富集分析-一網(wǎng)打盡(GO.KEGG.GSVA.GSEA)這里記錄一下自己對(duì)單細(xì)胞對(duì)象做富集分析時(shí)的過(guò)程以及所用的代碼，以免下次重頭再找，非常麻煩。 參考文獻(xiàn)：?jiǎn)渭?xì)胞各個(gè)亞群基因按照平均表達(dá)量排序后gsea分析 (qq.com)[h...
-
2023-09-13-SCENIC 踩坑全記錄-第一篇下載數(shù)據(jù)： 1. 網(wǎng)站地址: https://resources.aertslab.org/cistarget/databases/old/[https://resource...
-
cellphoneDB嘔心瀝血下載安裝教程
我安裝了一天之后快哭了，然后去100塊買了個(gè)老師指導(dǎo)生信自學(xué)要么哭要么花錢，就是我這個(gè)垃圾1、安裝https://github.com/ventolab/CellphoneD...
-
Python學(xué)習(xí) day1-2021.2.27（認(rèn)識(shí)Python）Python基礎(chǔ)課 課程鏈接：https://www.bilibili.com/video/BV1vA411b7Rn?p=1[https://www.bilibili.com...
-
-
通過(guò)BLAST進(jìn)行引物設(shè)計(jì)法古今完人 Date: November 25, 2022 首先，需要知道你想要設(shè)計(jì)引物的基因以及你需要干啥 以PLIN2（homo）為例 打開(kāi)網(wǎng)站Ensembl genom...
-
2023-02-14-R paletteer包，選擇多種配色在做一些可視化手動(dòng)添加配色的時(shí)候，遇到以下問(wèn)題： 經(jīng)常會(huì)因?yàn)榧?xì)胞類型數(shù)目太多而不知道該怎么選擇配色 選好了配色之后一個(gè)個(gè)手敲或者復(fù)制挺麻煩的 下面介紹一個(gè)配色包：palett...
