Illumina是常見的3大制造商之一，lumi包主要針對Illumina公司出品的bead系列表達譜和甲基化芯片進行質控、標準化，獲得表達矩陣。它已經封裝好lumiExpr...
發(fā)簡信
IP屬地：天津
-
R|illumina芯片beads系列-lumi -
熱圖復現-2022.12.3原圖 復現結果 代碼 重點： 對圖例各參數的調整 image.png，其中需要注意的是，當圖例是連續(xù)變量時，修改寬度用grid_width=unit(0.3,'cm'),修改...
-
棒棒糖圖復現效果 原圖 配色懶得改了，隨便選的幾個配色。復習了一下ggplot2畫圖語法，好久沒畫圖，都忘完了?。。W習了一下geom_rect()函數和geom_abline()函數的...
-
微衛(wèi)星不穩(wěn)定性（MSI）、錯配修復（MMR）和腫瘤突變負荷（TMB）概念及關系記錄
胚系突變（Germline Mutation）是指在人的胚胎發(fā)育期已經攜帶的變異（幾乎全部遺傳自父母），存在于生殖細胞內具有遺傳性，構成人與人的遺傳多樣性。 人體的所有細胞均...
-
biomarker與gene signature
gene signature 基因簽名（特征）或基因表達簽名（特征）是細胞中由于（改變或尚未改變的）生物過程或致病的醫(yī)學條件而產生的具有獨特特征的基因表達模式的單一或組合基因...
-
pdftools——提取PDF文本內容
因工作需要，希望快速提取pdf中的文本內容，但是又不想用pdf轉換工具（容易亂碼），因此搜索了R語言有沒有能夠實現PDF文本提取的包，發(fā)現了pdftools包用來提取pdf指...
-
簡單小需求：如何將FPKM轉換成TPM？
劉小澤寫于19.2.21或許這還是個比較常用的需求 我們做轉錄組分析，得到的結果可能是FPKM。但是FPKM確實存在不準確性，推薦使用TPM。 read count和FPKM...
