發(fā)簡(jiǎn)信
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ggplot2中theme函數(shù)調(diào)整整理一下ggplot2中theme函數(shù)的用法，牽扯到很多參數(shù)，怕自己下次忘了。 一、自帶主題 ggplot2有內(nèi)置主題，分別是：theme_gr...
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UCSC ENSEMBL NCBI基因組各個(gè)版本對(duì)應(yīng)關(guān)系 下載地址
一、對(duì)應(yīng)關(guān)系 NCBI的版本包括GRCh36,37,38，UCSC包括hg18,19,38, ENSEMBL有各種release，他們之間的對(duì)應(yīng)...
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單細(xì)胞測(cè)序R包PAGODA使用pagoda是2016年在nature methods發(fā)表的一個(gè)分析單細(xì)胞測(cè)序的方法，這個(gè)包并不是很紅火，只是最近在學(xué)習(xí)另一個(gè)基于RNA速率推斷...
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R中連接
在R語(yǔ)言中 paste 是一個(gè)很有用的字符串處理函數(shù)，可以連接不同類型的變量及常量。 函數(shù)paste的一般使用格式為： paste(..., s...
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RNA-seq分析：從fastq到差異表達(dá)基因
RNA-seq的數(shù)據(jù)分析是比較簡(jiǎn)單基礎(chǔ)的分析，大概流程就是處理下機(jī)的fastq數(shù)據(jù)（trimmomatic），比對(duì)到人類基因組（hisat2）然...
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maftools使用maftools是對(duì)WGS和WES數(shù)據(jù)進(jìn)行上游分析之后，進(jìn)行somatic mutation分析的一個(gè)非常好用的包，用非常簡(jiǎn)短的幾行代碼即可出圖...