發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：江蘇
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計(jì)算CDS長(zhǎng)度
下載TCGA 基因注釋文件：gencodev22https://gdc.cancer.gov/about-data/data-harmonization-and-genera...
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DMR甲基化數(shù)據(jù)分析(1)Nathan寫于20200804。 由于最近開(kāi)展了一些DNA甲基化的項(xiàng)目，跑了幾個(gè)預(yù)實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù)，結(jié)果還不錯(cuò)。所以在此記錄一下分析步驟和代碼。本次數(shù)據(jù)分析使用的軟件是BatMe...
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SyRI：從全基因組組裝中找到基因組重排和局部序列差異基因組差異從單核苷酸差異到復(fù)雜的結(jié)構(gòu)變異。當(dāng)前的方法通常能準(zhǔn)確地注釋從SNP到大插入缺失的序列差異，但無(wú)法揭示結(jié)構(gòu)重排的全部復(fù)雜性，包括倒置，易位和重復(fù)，其中位置，方向或拷貝...
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利用orthofinder尋找單拷貝基因構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)新的系列系列教程[http://www.itdecent.cn/p/10bb4410ae3d]已上傳，大家可以去看新的教程 1.orthofinder介紹 OrthoFin...
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基因組基因復(fù)制的分類鑒定：DupGen-finder
參考：http://www.itdecent.cn/p/0a14d971bd0a[http://www.itdecent.cn/p/0a14d971bd0a] requi...
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LTR-RTs的鑒定,LAI值的計(jì)算LAI是一種新的評(píng)估基因組組裝質(zhì)量的評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)。LTR講解[http://www.itdecent.cn/p/a93cdbc36339]部分轉(zhuǎn)載自https://www.ji...
