發(fā)簡(jiǎn)信
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Jupyter Lab | “丟下R，一起來快樂地糟蹋服務(wù)器！”寫作前面 工具永遠(yuǎn)只是為了幫助自己提升工作效率 —— 沃茲基·碩得 所以說，為什么要使用jupyterlab呢？當(dāng)然是因?yàn)榛诜?wù)器來處理數(shù)據(jù)就...
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同源基因鑒定 | OrthoFinder 2.0 + MAFFT + IQtree
寫在前面 寫這個(gè)貼子純粹為了記錄一下自己的雙面打工人的生活，然后再總結(jié)一下自己的工作方法還有哪些地方存在問題，希望下次再遇到這些小問題的時(shí)候可以...
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「數(shù)據(jù)不給下，那就試試scrapy吧！」
寫在前面 聲明一下代碼不是我寫的，“我不生產(chǎn)代碼，我只是代碼的搬運(yùn)工” 本文目的是稍微記錄和分享，如何使用srapy來爬取OMIM數(shù)據(jù)庫(kù)，學(xué)習(xí)P...
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「來繪圖吧！」鏈特異性測(cè)序的read depth繪制以釀酒酵母為例，用到的數(shù)據(jù)如下，隨便找一個(gè)鏈特異性測(cè)序的fastq用常見比對(duì)軟件跑一下都行。有一些數(shù)據(jù)我放在github，可參考：https:/...
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讀《Python神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)編程》| “小學(xué)二年級(jí)都能學(xué)會(huì)的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)編程”
神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)、AI等詞匯出現(xiàn)的頻率在現(xiàn)如今是非常高的。 非人工智能專業(yè)的同學(xué)有沒有必要學(xué)呢？ 當(dāng)出現(xiàn)了線性方法不可以解決的生物學(xué)問題時(shí)，神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)就應(yīng)...
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方法解讀 | 性染色體Phasing本篇文章學(xué)習(xí)、解析的內(nèi)容來自《Genomes of the Banyan Tree and Pollinator Wasp Provide In...
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「干活」基因組組裝之前要做的：Genome Survey基因組組裝之前，有一些問題還是需要注意的， genome size是多少？ 評(píng)估得到的genome heterozygosity是多少？ 重復(fù)序...
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服務(wù)器網(wǎng)絡(luò)丟包率100%，連接不上外網(wǎng)怎么辦？
一個(gè)簡(jiǎn)單的記錄 服務(wù)器選址不對(duì)，時(shí)不時(shí)會(huì)發(fā)生丟包的問題，重啟路由器無果，結(jié)果root權(quán)限下一行命令搞定了， 后話 網(wǎng)絡(luò)知識(shí)不能丟，偶爾搞搞服務(wù)器...
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「干活」基因組組裝 學(xué)習(xí)筆記 - 入門知識(shí)點(diǎn)和Genome Survey
基因組組裝學(xué)習(xí)筆記（一） 基因組組裝的前期工作：需要掌握什么知識(shí)點(diǎn)？ 1）基因組大小 / genome size： 一般有兩種辦法，使用流式細(xì)胞...