不知覺(jué)間，距離我寫(xiě)下第一篇關(guān)于 WGS 數(shù)據(jù)分析系列的文章已經(jīng)過(guò)去了三年多（WGS 系列文章[https://mp.weixin.qq.com/mp/homepage?__b...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：江蘇
-
ilus: 這是我寫(xiě)的一個(gè)輕量級(jí)全基因組（WGS）和全外顯子（WES）最佳實(shí)踐分析流程生成器 -
【陪你學(xué)·生信】十三、蛋白質(zhì)3D結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單預(yù)測(cè)
?我們關(guān)注蛋白質(zhì)的功能，而結(jié)構(gòu)和功能聯(lián)系緊密。一旦在氨基酸序列水平發(fā)現(xiàn)有趣的序列（比如一個(gè)模體（motif）或者進(jìn)化上保守的片段），下一步往往就是研究這段序列的3-D結(jié)構(gòu)。（...
-
基于AlphaFold2進(jìn)行蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)的文章解析01 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)基礎(chǔ) 基礎(chǔ)介紹[1][#fn1] 蛋白質(zhì)是一切生命系統(tǒng)的物質(zhì)基礎(chǔ)，密切每一個(gè)生理過(guò)程。 每個(gè)蛋白質(zhì)因基酸鏈的組成、扭轉(zhuǎn)、彎曲等等構(gòu)成不同具有特異的結(jié)構(gòu)，決定...
-
Guideseq分析流程Guideseq是一種檢測(cè)體內(nèi)基因編輯脫靶的測(cè)序方法，基本原理是CRISPR系統(tǒng)剪切基因組后，在進(jìn)行基因組修復(fù)時(shí)可能會(huì)將一段設(shè)計(jì)好的雙鏈DNA，即tag，插入到基因組中，通過(guò)...
-
正則表達(dá)式: re
Python 通過(guò)標(biāo)準(zhǔn)庫(kù)的 re 模塊支持正則表達(dá)式，re 模塊的函數(shù)和正則表達(dá)式的使用規(guī)則記錄于此，便于日后查閱。 re模塊函數(shù) 函數(shù)/方法描述compile( patte...
-
python open函數(shù)newline參數(shù)
python open函數(shù)的newline參數(shù)控制著如何轉(zhuǎn)換和輸出換行符，下面是官方解釋: newline controls how universal newlines w...
-
BLOSUM矩陣的推導(dǎo)
BLOSUM62是應(yīng)用得最廣的氨基酸替換矩陣，是BLAST中蛋白質(zhì)序列比對(duì)的默認(rèn)矩陣。 1. 如何下載替換計(jì)分矩陣 ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/...
-
TCGAbiolinks全解析
部分一 第一步、數(shù)據(jù)下載階段 第二步：GDCdownload()下載GDCquery()得到的結(jié)果 第三步、數(shù)據(jù)處理 第四步：TCGAanalyze_Preprocessin...
