運行GATK時，報錯：java.lang.IllegalArgumentException: samples cannot be empty這個問題在GATK Forum有...
發(fā)簡信
IP屬地：上海
-
GATK - Read groups
-
fastq序列質(zhì)量Q30統(tǒng)計軟件
FaQCs 使用perl編寫，R畫圖。不僅可以統(tǒng)計質(zhì)量，Q30，還可以trim序列。安裝簡單準備好兩個需要的perl 模塊,下載github上的文件，然后直接cd lib;....
-
使用busco進行基因組質(zhì)量評估BUSCO是一款使用python語言編寫的對轉(zhuǎn)錄組和基因組組裝質(zhì)量進行評估的軟件。在相近的物種之間總有一些保守的序列，而BUSCO就是使用這些保守序列與組裝的結(jié)果進行比對，鑒...
-
啥時候能賺到100萬？
疫情突然襲來，好多實體店都關門了，原準備也盤個店做點啥生意賺點錢呢，三年的疫情，現(xiàn)在沒有膽量去盤店了，深怕自己攜帶全家陷入泥潭無法自拔，還是保守點好了。 那么話說回來了，保守...
-
生物信息軟件/流程dockerfile打包參考
生信軟件、流程依賴的東西太多，docker打包鏡像一不小心就是上Gb大小。 鏡像太大很多缺點：上傳、拉取慢；費寬帶；占空間。。。 docker已廣泛應用在IT，生信只是沾了點...
-
微生物群落的安娜·卡列尼娜原則AKP預測微生物對擾動的反應是微生物學的一個基本挑戰(zhàn)。大多數(shù)關于微生物組動力學的研究都集中于研究微擾使動物微生物群從健康狀態(tài)轉(zhuǎn)變?yōu)榉墙】捣€(wěn)定狀態(tài)的模式。 本文提出了另一種設想，即許...
-
canu 組裝PacBio數(shù)據(jù)
基因組組裝的三個層次，contig, scaffold和chromosomes.contig表示從大規(guī)模測序得到的短讀(reads)中找到的一致性序列。組裝的第一步就是從短片...
