前面測試了常見的人類和小鼠的數(shù)據(jù)集，但是我自己是做植物的。如果想要運行pySCENIC，就需要去建立自己的數(shù)據(jù)庫。關于這塊網(wǎng)上的資料，我自己也是遇到了一些問題，現(xiàn)在把自己的流...
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【pySCENIC】構建其它物種的motif數(shù)據(jù)庫 -
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【DoRothEA】單細胞轉(zhuǎn)錄因子分析今天學習另外一個轉(zhuǎn)錄因子活性預測工具：DoRothEA。很多文章用的也是這個工具，看起來比pySCENIC好像快很多。其實，單細胞轉(zhuǎn)錄因子分析本質(zhì)上是計算一種specific...
