--K-Means clustering 實戰(zhàn)教程，只強調(diào)實操，目的意義請移步我上篇博文 http://www.itdecent.cn/p/a01d26c61f77 一. ...
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Patternize實戰(zhàn)1: 分析顏色模式的R包 -
從fastq數(shù)據(jù)到SNV | GATK
00 寫在前面 僅針對人類WGS或WES數(shù)據(jù)，供參考。時間管理某一點：能自動化的工作盡量自動化，不要時間用在毫無意義的重復(fù)上。腦袋好比肌肉，需要不斷提高負重的鍛煉才能達到“有...
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SPAdes組裝二代、三代測序數(shù)據(jù)導(dǎo)讀 SPAdes是2012年發(fā)表在Journal of Computational Biology上的一篇文章提出的二代測序組裝軟件，是目前引用量已經(jīng)達到6200+，在宏基...
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三代轉(zhuǎn)錄組系列：使用Cogent重建基因組編碼區(qū)盡管目前已測序的物種已經(jīng)很多了，但是對于一些動輒幾個G的復(fù)雜基因組，還沒有某個課題組有那么大的經(jīng)費去測序，所以仍舊缺少高質(zhì)量的完整基因組，那么這個時候一個高質(zhì)量的轉(zhuǎn)錄組還是能...
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OrthoFinder尋找同源基因并建樹提到尋找物種之間的同源基因，大家一般想到的是OrthoMCL (http://orthomcl.org/orthomcl/） ，OrthoMCL是現(xiàn)在用的最多的一款來找直系同...
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使用dplyr包處理數(shù)據(jù)-學(xué)習筆記
# dplyr 基礎(chǔ) 按值篩選觀測 filter() 對行進行重新排序 arrange() 按名稱選取列變量 select() 使用現(xiàn)有變量的函數(shù)創(chuàng)建新變量 mutate()...
