一、 簡(jiǎn)述 ? ? 為了從基因的表達(dá)水平中得到更加具體直觀的生物學(xué)功能變化的信息，多種基于已知的基因集的分析方法應(yīng)運(yùn)而生。其中，基因集分析（Gene Set Analysis...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：重慶
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GSA、GSEA、ssGSEA、GSVA的算法原理及它們的聯(lián)系與區(qū)別 -
也談火山圖逐漸感覺到，一些人正在將生信分析帶偏，他們著重強(qiáng)調(diào)圖片的觀賞性，而忽視了生信分心的本質(zhì)不是為了文章湊圖片，而是能利用大數(shù)據(jù)分析觀測(cè)到wet lab實(shí)驗(yàn)不能觀測(cè)的新視角，提供新...
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【R畫圖學(xué)習(xí)13.4】散點(diǎn)圖---單細(xì)胞不同亞群火山圖下面這個(gè)圖是我在單細(xì)胞相關(guān)文章中見過的，也算是火山圖的變種?？梢钥闯鯴軸是不同的細(xì)胞類型，Y軸是marker基因的fold change（log2）,但是不同類別之間他們是不...
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R語言Cibersort文件獲取+代碼在R語言中運(yùn)行Cibersort共需要三個(gè)文件，分別是（1）官方提供的22種細(xì)胞基因集“LM22.txt”；（2）自己的表達(dá)矩陣；（3）Cibersort代碼。 （1）LM2...
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差異分析的檢驗(yàn)方法前言 眾所周知，當(dāng)你所自己今年比去年更優(yōu)秀的時(shí)候是不可以隨便吹牛的，請(qǐng)把你在簡(jiǎn)書上發(fā)文的頻率以及質(zhì)量擺出來！ 面對(duì)今年和去年的數(shù)據(jù)，或許你需要一個(gè)統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)的方法... 組間差...
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服務(wù)器Jupyter Notebook和Samba的安裝及部署——by不是殺殺Samba是在Linux和UNIX系統(tǒng)上實(shí)現(xiàn)SMB協(xié)議的一個(gè)免費(fèi)軟件，由服務(wù)器及客戶端程序構(gòu)成（來自百度百科），簡(jiǎn)單來說它可以實(shí)現(xiàn)服務(wù)器端（Linux）與Wi...
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KEGG通路數(shù)據(jù)庫下載(人種)
方法一在MSigDB下載，網(wǎng)址GSEA | MSigDB | MSigDB Collections。下載到 gmt 格式文件使用 GSEABase 包的 getGmt 函數(shù)讀...
