導(dǎo)讀 BPGA是Bacterial Pan Genome Analysis tool的簡寫，16年發(fā)表的工具，17年最后一版更新，內(nèi)置KEGG COG數(shù)據(jù)（老了），依賴use...
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BPGA分析細(xì)菌泛基因組 -
BPGA--細(xì)菌泛基因組分析軟件包經(jīng)歷過OrthoMCL軟件包安裝的艱辛（然而，終究也沒安裝成功），就知道轉(zhuǎn)而用BPGA包是有多么香了。話不多說，來看看BPGA是如何安裝且使用的吧 一、BPGA下載和安裝 首...
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10-【BPGA】的安裝和使用
安裝時(shí)間：2021.2.17 1. 簡介 BPGA是一款快速的泛基因組分析軟件。似乎好像在windows上安裝較為方便。在Linux下沒有conda安裝版本，只能手動(dòng)進(jìn)行安裝...
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diamond比對(duì)以及結(jié)果數(shù)據(jù)處理
利用diamond比對(duì)數(shù)據(jù) 注意：diamond在無root權(quán)限的linux運(yùn)行比對(duì)命令時(shí)需要加參數(shù)-t /dev/shm創(chuàng)建臨時(shí)文件 注意事項(xiàng):默認(rèn)參數(shù)主要是針對(duì)段短序列，...
