我的TCGA數(shù)據(jù) 樣本名稱是TCGA-G3-A3CH-11的, 為什么代碼都能跑下來,可結(jié)果是只有一列基因的名稱??!求解答!!
TCGA基因表達(dá)數(shù)據(jù)和生存數(shù)據(jù)合并打開臨床數(shù)據(jù)excel,分別自定義排序futime和fustat,futime中去掉生存天數(shù)為0和沒有的數(shù)據(jù),fustat中去掉無生存狀態(tài)的數(shù)據(jù)(1為死亡,0為存活) 將上圖...
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你好,請問問題解決了嗎?我估計(jì)我也是樣本命名的原因,自學(xué)網(wǎng)是從GDC-TCGA下的,我是從UCSC上下的,樣本命名不一樣,我在合并數(shù)據(jù)的時(shí)候最終結(jié)果是只有基因名稱,而臨床數(shù)據(jù)都沒有
TCGA合并GETx數(shù)據(jù)進(jìn)行免疫lncRNA提取,代碼提問問題如下: 下載TCGA腫瘤樣本,但該數(shù)據(jù)中無正常組織,合并GETx數(shù)據(jù)進(jìn)行免疫lncRNA提取,代碼部分如下: rm(list = ls()) library(limma)...