DESeq2分析差異基因/ASV時，如果全部基因/ASV都存在0，那么將會因?yàn)閹缀纹骄鶖?shù)全部為0，導(dǎo)致估算sizefactor失敗而報(bào)錯。 因?yàn)槟J(rèn)的計(jì)算sizefactor...
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差異分析存在許多含零的行 ｜ Deseq2 -
基于qiime2的擴(kuò)增子流程寫在前面：擴(kuò)增子在微生物組領(lǐng)域就像分子生物學(xué)里面的PCR一樣常見、有用，像繁瑣的PCR一樣（雖然有說明書告訴你引物、Taq酶、dNTPs等的加入量，但是每次都加也很繁瑣），擴(kuò)...
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HISAT2 建立索引警告和比對時報(bào)錯解決方案
tags： HISAT2 RNA-seq HISAT2 發(fā)表的文章中強(qiáng)調(diào)了它的速度很快，我就測試了一下這個工具。 HISAT2 建立索引： 然而沒多久就看到這樣的警告： 只是...
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6.ggplot2——繪制地圖6 地圖 地圖繪制是一項(xiàng)常見的可視化任務(wù)，需要用到專門的工具。主要解決兩個方面的問題：使用一個數(shù)據(jù)源繪制地圖，以及將另一個信息的數(shù)據(jù)添加到地圖中。 6.1 矢量邊界 使用ge...
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R | ggplot2拼圖 —— patchwork在Y叔公號（biobabble）看到cowplot乃舊愛，patchwork是新歡[https://mp.weixin.qq.com/s/Y_uK2H7ketmFpJMvkN...
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binmap-123原網(wǎng)址：1）http://www.jintiankansha.me/t/etiz287dU8 2）http://www.jintiankansha.me/t/i81Con4f...
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關(guān)于SNP的過濾（1）：如何使用vcftools進(jìn)行SNP過濾
前言 很多關(guān)注我這個專題的朋友都在后臺留言，說想了解更多關(guān)于SNP過濾的東西。是的，確實(shí)這是一個比較重要的問題。第一，過濾到一些低質(zhì)量的SNP可以防止calling一些假陽性...
