寫在前面的話:GSEA對于生物信息學(xué)技能的要求不高,以至于不需要太多的生信知識就能學(xué)會,這也成為了生物研究生的必備技能,如果你還不會的話,這篇教程將讓你100%學(xué)會,只要你從...
基因表達(dá)差異分析是我們做轉(zhuǎn)錄組最關(guān)鍵根本的一步,edgeR+limma是目前最為推薦的方式。本文結(jié)合示例數(shù)據(jù),將對這個過程進(jìn)行梳理,讓你明白limma包的why,what,h...
1 摘要 簡單且高效地分析RNA測序數(shù)據(jù)的能力正是Bioconductor的核心優(yōu)勢之一。在獲得RNA-seq基因表達(dá)矩陣后,通常需要對數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理、探索性數(shù)據(jù)分析、差異表...
今天跟大家分享的是2020年1月發(fā)表在Genome Biol.(IF:14.028)雜志上的一篇文章A benchmark of batch-effect correctio...
Differential gene expression analysis:差異表達(dá)基因分析 Differentially expressed gene (DEG):差異表達(dá)...
目錄 1. 標(biāo)準(zhǔn)化1.1. House-keeping gene(s)1.2. spike-in1.3. CPM1.4. TCS1.5. Quantile1.6. Media...
王瀟瀟灑姐常常掛在嘴邊的一句話是,“勇猛精進(jìn)”。很喜歡這句slogan,“精進(jìn)”意味著熟練和進(jìn)步,“勇猛”意味著高效和果斷。進(jìn)步當(dāng)然是好事,但遲緩的進(jìn)步就像過期的禮物,很難讓...
今天和一群小伙伴跑了個馬拉松,準(zhǔn)確來說,我和一小撮兒群眾參加了五公里的快樂跑,大部分人參加的是半馬,有幾位大牛參加了全馬(而且竟然完成了,真的是大牛,至少不再是人類了)。 不...