可變剪接(Alternative splicing)：一個基因的外顯子以不同的組合方式剪接形成不同的成熟RNA，由此產(chǎn)生的不同的 mRNA 可能被翻譯成不同的蛋白質(zhì)構(gòu)體，因此...
發(fā)簡信
IP屬地：青海
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2021-04-30 可變剪接與rMATS分析 -
文獻分享33：泛基因組分析揭示了與黍稷馴化相關(guān)的基因組變異文獻 2023 Nature Genetics Pangenome analysis reveals genomic variations associated with d...
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生信分析32：deeptools軟件介紹Fig 1 對于各種表觀組學(xué)，如ChIP-seq、ATAC-seq、CUT&TAG、MNase-seq，deeptools是下游分析中非常常用的軟件之一。該軟件發(fā)表于2014...
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文獻分享32：表觀遺傳修飾調(diào)控小麥品種特異的根系發(fā)育和對氮素可利用性的代謝適應(yīng)文獻 2023 Nature Communications Epigenetic modifications regulate cultivar-specific root ...
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生信分析31：基于metilene鑒定差異甲基化區(qū)域目前，WGBS（Whole genome bisulfite sequencing）仍是檢測全基因組DNA甲基化的金標(biāo)準(zhǔn)。下游分析中，鑒定差異甲基化區(qū)域（Differenti...
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文獻分享31：多組學(xué)分析揭示了野生大麥在進化坡（Tabigha）的土壤適應(yīng)機制文獻 2021 Advanced Sciene Multi-Omics Analysis Reveals the Mechanism Underlying the Edaph...
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生信分析30：基于二代轉(zhuǎn)錄組測序檢測APA事件本次推送是文獻分享30的對應(yīng)內(nèi)容。 多聚腺苷酸化 (ployA) 是真核生物中一種重要的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控機制，它調(diào)節(jié) pre-mRNA的成熟。 對于很多基因來說，該過程可以發(fā)生在多...
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文獻分享30：植物生長阻滯誘導(dǎo)石榴矮化的全基因組范圍選擇性多聚腺苷酸化特征文獻 2023 Frontiers in plant science Genome-wide alternative polyadenylation dynamics und...
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生信分析29：基于單拷貝直系同源基因構(gòu)建物種進化樹本次推送是文獻分享29的對應(yīng)內(nèi)容。 Fig 1 基因組和比較基因組相關(guān)的文章中，最常放的一個圖是對該物種和其他近緣物種以及外群構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹（Fig 1），用來研究物種的進化...
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文獻分享29：異源四倍體豆科植物田菁的T2T基因組揭示了轉(zhuǎn)座子驅(qū)動的亞基因組分化和堿脅迫耐受機制文獻 2023 Science China Life Sciences Telomere-to-telomere genome of the allotetraploid l...
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文獻分享28：scRNA-seq揭示棉花側(cè)生分生組織再生能力的分子機制文獻 2023 Genome Biology Single-cell resolution analysis reveals the preparation for repr...
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生信分析27：基于Ks計算全基因組復(fù)制事件全基因組復(fù)制事件（WGD）是某物種的全部染色體由于某種原因整體發(fā)生復(fù)制而加倍的事件。整體加倍可以是增加一倍，即二倍化事件，也可能增加了兩倍，即三倍化事件。 大多數(shù)被子植物都經(jīng)...
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生信分析26：對LTR-RTs構(gòu)建進化樹本次推送是文獻分享26的對應(yīng)內(nèi)容。我與生信，公眾號：我與生信文獻分享26：優(yōu)質(zhì)牧草羊草的基因組演化與育種[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mz...
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文獻分享26：優(yōu)質(zhì)牧草羊草的基因組演化與育種文獻 2023 PNAS Genome evolution and initial breeding of the Triticeae grass Leymus chinen...
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文獻分享24：六倍體小麥胚胎發(fā)育過程的表觀調(diào)控文獻 2023 Genome Biology Dynamic chromatin regulatory programs during embryogenesis of he...
