今天是國慶節(jié)，祝祖國繁榮昌盛，國泰民安！ 我們這里30號又有疫情了，由原來的七天兩檢，今天改成了兩天一檢了。形勢嚴峻，我們每天要把檢測記錄截圖，發(fā)工作群里。 國慶七天長假，今...
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叔叔以他的方式為祖國慶生 -
2021-04-29 TCGA與GTEX數(shù)據(jù)下載數(shù)據(jù)庫背景介紹 TCGA，全稱：The cancer genome altas官網(wǎng)：https://cancergenome.nih.gov/[https://cancerg...
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R ESTIMATE計算免疫基質(zhì)得分以及腫瘤純度ESTIMATE計算免疫基質(zhì)得分以及腫瘤純度 1.概述 Estimate根據(jù)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)來計算免疫基質(zhì)得分，也可得到腫瘤樣本的腫瘤純度 其原理本質(zhì)上是先收集好免疫基因集和基質(zhì)基...
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通過GSVA與相關(guān)性分析尋找目的基因的相關(guān)通路
最近幫師弟做一個GSVA分析，發(fā)現(xiàn)已經(jīng)忘的差不多了，順便整理一下吧。 基因集變異分析（Gene Set Variation Analysis, GSVA）可以將一個基因表達矩...
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【r<-芯片處理】入門GEO表達芯片數(shù)據(jù)分析該讀一讀的一些文章
剛參加完生信技能樹TCGA挖掘培訓回來，里面內(nèi)容有不少涉及GEO數(shù)據(jù)分析方面。下面整理一些非常值得一讀都一些文章，幫助初學者掌握一些基本概念，基本流程。一旦你理解并學會使用R...
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轉(zhuǎn)錄調(diào)控：轉(zhuǎn)錄因子特征總結(jié)[轉(zhuǎn)載]轉(zhuǎn)錄調(diào)控：轉(zhuǎn)錄因子特征總結(jié) 典型的轉(zhuǎn)錄因子功能示意圖(Schematic of a prototypical TF). 轉(zhuǎn)錄因子一般具有兩種結(jié)構(gòu)域： 1. DNA-bindi...
