今天是國慶節(jié),祝祖國繁榮昌盛,國泰民安! 我們這里30號又有疫情了,由原來的七天兩檢,今天改成了兩天一檢了。形勢嚴峻,我們每天要把檢測記錄截圖,發(fā)工作群里。 國慶七天長假,今...
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數(shù)據(jù)庫背景介紹 TCGA,全稱:The cancer genome altas官網(wǎng):https://cancergenome.nih.gov/[https://cancerg...
ESTIMATE計算免疫基質(zhì)得分以及腫瘤純度 1.概述 Estimate根據(jù)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)來計算免疫基質(zhì)得分,也可得到腫瘤樣本的腫瘤純度 其原理本質(zhì)上是先收集好免疫基因集和基質(zhì)基...
最近幫師弟做一個GSVA分析,發(fā)現(xiàn)已經(jīng)忘的差不多了,順便整理一下吧。 基因集變異分析(Gene Set Variation Analysis, GSVA)可以將一個基因表達矩...
剛參加完生信技能樹TCGA挖掘培訓回來,里面內(nèi)容有不少涉及GEO數(shù)據(jù)分析方面。下面整理一些非常值得一讀都一些文章,幫助初學者掌握一些基本概念,基本流程。一旦你理解并學會使用R...
轉(zhuǎn)錄調(diào)控:轉(zhuǎn)錄因子特征總結(jié) 典型的轉(zhuǎn)錄因子功能示意圖(Schematic of a prototypical TF). 轉(zhuǎn)錄因子一般具有兩種結(jié)構(gòu)域: 1. DNA-bindi...