下載安裝包 把自己想轉(zhuǎn)換的人的基因名合并成建立一個(gè)向量 使用這個(gè)包的函數(shù)getLDS 運(yùn)行后得到下面結(jié)果 有個(gè)問(wèn)題是有個(gè)人的基因在這個(gè)庫(kù)里沒(méi)有找到 "GNLY"；沒(méi)有搞清楚...
IP屬地：上海
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BiomaRt-進(jìn)行人基因到小鼠基因的ID轉(zhuǎn)換 -
METASOFT使用教程Meta回歸分析的原理 Meta回歸分析可評(píng)價(jià)研究間異質(zhì)性的大小及來(lái)源。假如一項(xiàng)元分析納入了20項(xiàng)研究，其中一些研究發(fā)現(xiàn)體育鍛煉能改善抑郁癥狀，一些發(fā)現(xiàn)體育鍛煉對(duì)抑郁情緒沒(méi)有...
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機(jī)器學(xué)習(xí)：11. SVM支持向量機(jī)（上）1 概述 支持向量機(jī)（SVM，也稱為支持向量網(wǎng)絡(luò)），是機(jī)器學(xué)習(xí)中獲得關(guān)注最多的算法沒(méi)有之一。從實(shí)際應(yīng)用來(lái)看，在生物科學(xué)的尖端研究中，人們使用支持向量機(jī)來(lái)識(shí)別用于模型預(yù)測(cè)的各種...
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WGS分析筆記（5）—— annotation?? 在找到很多變異以后（本文具體指的是snv以及indel），我們需要做的就是進(jìn)行注釋了，這是因?yàn)闊o(wú)論WGS還是WES，都會(huì)call出大量的變異。即使是一個(gè)正常人，也會(huì)有百...
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GATK4全基因組數(shù)據(jù)分析最佳實(shí)踐,我以這篇文章為標(biāo)志,終結(jié)當(dāng)前WGS系列數(shù)據(jù)分析的流程主體問(wèn)題 | 完全代碼這是我根據(jù)之前的WGS系列和GATK4實(shí)踐文章進(jìn)行重新梳理之后確定下來(lái)的分析流程，這是一個(gè)WGS的最佳實(shí)踐，它基于GATK4和我的實(shí)際經(jīng)驗(yàn)，稍作修改即可應(yīng)用到實(shí)際的項(xiàng)目中。我...
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WGS分析筆記（4）—— Call SNVs/indels??最近一直忙期末匯報(bào)和腳本編寫，沒(méi)來(lái)的及接著往下寫文章，年前把這一塊寫了，然后再往下的分析流程就比較特異性了，做一步寫一步那種，相對(duì)于這種已經(jīng)常規(guī)化的流程（除了一些細(xì)節(jié)上的...
