記錄下小編自己可能用到的小腳本 （1）fasta轉(zhuǎn)phylip格式 用法：python fa2phy.py seq.fasta seq.phy （2）fastq轉(zhuǎn)fast...
IP屬地：西藏
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單細(xì)胞ChIP-seq方法的比較寫在前面的廢話 這篇文章來自于一個舔狗的悲哀，謹(jǐn)以此文告訴大家莫當(dāng)舔狗…… 以上聊天記錄，就是整個故事背景。當(dāng)時我的內(nèi)心歷程： 我看過類似的文章欸，趕緊發(fā)出來展現(xiàn)一下我的閱讀...
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fastp：數(shù)據(jù)質(zhì)控 + 過濾
之前都是用 fastqc+trimmomatic進行數(shù)據(jù)質(zhì)控和過濾，但是fastp更方便也更快，而且可以一次完成質(zhì)控過濾和出圖。 1. Fastp 軟件安裝 可以直接用con...
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2022-01-27參考：生物信息學(xué)100個基礎(chǔ)問題——第1~ 5題 答案公布 - 知乎 (zhihu.com)[https://zhuanlan.zhihu.com/p/34957915] 掌...
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生信地基系列--生物信息ID的轉(zhuǎn)換
1.同物種ID的轉(zhuǎn)換 Gene id 轉(zhuǎn)換(四種基因各種id轉(zhuǎn)換方法)_易易歡歡的博客-CSDN博客_gene id轉(zhuǎn)換[https://blog.csdn.net/weix...
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grabseqs——批量下載sra數(shù)據(jù)并直接轉(zhuǎn)換為fastq文件的工具文章：grabseqs: simple downloading of reads and metadata from multiple next-generation seq...
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生信Linux常用命令（更新中）
一、壓縮和解壓縮 1.“.tar.gz”結(jié)尾的文件: tar tar -cf newfile.tar file1 file2#將file1，file2文件打包到newfile...
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2022-07-12 Seurat復(fù)習(xí)
基本流程：數(shù)據(jù)導(dǎo)入，QC去除低質(zhì)量細(xì)胞，歸一化，由于矩陣過于稀疏所以選取top1000~2000，對每個基因進行zscore，線性降維和非線性降維，聚類（基于線性降維的結(jié)果進...
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linux正則表達(dá)式學(xué)習(xí)1.通配符也叫文件名替換，它主要是作用于匹配文件名，常用命令是ls、find、cp、mv； 2.正則表達(dá)式主要是作用于匹配文件中的字符串,常用命令命令是grep、awk、se...
