細胞爬片免疫熒光： 第一天 在培養(yǎng)板中將已爬好細胞的玻片用PBS浸洗3次,每次5min;（圓蓋片：13mm 24孔；18mm 12孔；20mm 6孔） 用4%的多聚甲醛固定爬...
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無參轉錄組序列組裝 — Trinity轉錄組分析策略 轉錄組分析策略根據(jù)有無參考轉錄組可以分為兩類： 有參比對—定量—差異分析—功能富集分析等 無參組裝—定量—差異分析—功能富集分析等image 無參考轉錄組序列...
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細胞培養(yǎng)及轉染Protocol
實驗一：細胞的復蘇 一、目的： 掌握將凍存良好的細胞復蘇、培養(yǎng)的基本原理與方法。 二、原理： 細胞冷凍與復蘇是細胞培養(yǎng)的常規(guī)工作，可以解決細胞因為連續(xù)繼代造成的退變或轉化。細...
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Call種內微生物SNP用Parsnpparsnp可進行核心基因組對齊、call核心基因組SNP、構建SNP進化樹。 Github: https://github.com/marbl/parsnp[https:/...
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R 繪制花瓣圖flower plot花瓣圖 對于多樣本的研究，我們可以采用繪制花瓣圖來更直觀展現(xiàn)，每個樣本所獨有的otu數(shù)目和共有的otu數(shù)目。 花瓣圖繪制的原理 因為沒有一個相關的R包，參照的是博客（http...
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判斷GEO芯片數(shù)據(jù)表達矩陣是否需要log2轉換通過exprs函數(shù)獲取表達矩陣后我們可以通過以下三種方法判斷是否需要進行l(wèi)og2轉換 1.肉眼識別 最簡單粗暴的方法就是，根據(jù)數(shù)值大小粗略估計：如果表達量的數(shù)值在50以內，通...
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GEO數(shù)據(jù)庫挖掘—生信技能樹B站視頻以下是B站生信技能樹GEO數(shù)據(jù)庫挖掘的課程筆記 主要內容及學習目的： 介紹GEO數(shù)據(jù)庫：了解數(shù)據(jù)存放位置； 介紹GSE項目的3種下載方式； 介紹ID轉換：使用R語言技巧實現(xiàn)基...
