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該程序是獲得unique比對序列長度分布信息。 上面的程序無法流程化處理,可以調(diào)用python的sys來實(shí)現(xiàn)流程化的處理。
通常從測序公司拿到的fq文件分為四行,第一行為序列名稱,第二行為序列的堿基,第三行為序列名稱,通常用+號代替,第四行為堿基質(zhì)量。代碼如下: shell:
這里更詳細(xì)。Python官方文檔中文翻譯Python v2.7.8 中文文檔 對序列長度和名字提取之后往往是無序的,可以從以下代碼來排序
沒有成功誒~
簡書的代碼高亮展示(夜間閱讀模式)——to劉mingxing c c++ java python ruby php masakakaikai 511 6 3
c c++ java python ruby php