2019.8月中旬開始系統(tǒng)自學(xué)生信，<br>自學(xué)路漫漫索性報(bào)個(gè)班。<br><br>生信技能樹真的很棒！<br><br>這是我的一個(gè)學(xué)習(xí)筆記平臺(tái)，點(diǎn)滴記錄。
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對(duì)miRNAs靶基因進(jìn)行批量預(yù)測(cè)
1.提取miRNAs 2. 由starbase API數(shù)據(jù)庫進(jìn)行下載(10s檢索完成） 3.將所有的miRNA靶基因進(jìn)行合并整理 每個(gè)文件都有這么一個(gè)類似的表頭，與lncRN...
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請(qǐng)問怎么實(shí)現(xiàn)“下載數(shù)據(jù)庫中全部的lnc-miRNA的互作數(shù)據(jù)”呢，非常感謝樓主
從starBase批量下載數(shù)據(jù)
很多小伙伴都知道starBase是一個(gè)常用的數(shù)據(jù)庫，不管是根據(jù)microRNA找非編碼RNA，還是根據(jù)microRNA找mRNA靶點(diǎn)，還是查找ceRNA調(diào)控分子，還是查找RN...
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看不懂測(cè)序峰圖就好像有答案都不會(huì)抄
這篇文章的測(cè)序原理的部分本不在我的計(jì)劃范圍內(nèi)，原本只是想回復(fù)一下之前部分讀者關(guān)于套峰的問題，想著學(xué)習(xí)一下不同測(cè)序峰形的結(jié)果以及改進(jìn)方法。某天晚上我打開華大基因的網(wǎng)頁客戶端，檢...
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喜歡寫代碼的外科醫(yī)生。
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R包安裝失敗并報(bào)“ had non-zero exit status”
問題：draw_heatmap突然報(bào)錯(cuò)不能用，tinyarray包顯示無訪問權(quán)限。嘗試1： 重新安裝R，更改安裝包存儲(chǔ)路徑，工作目錄下放有小潔老師提供的AnnoProbe-m...
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gdc-client下載數(shù)據(jù)報(bào)錯(cuò)
對(duì)于同一份manifest，gdc-client時(shí)常也會(huì)出現(xiàn)報(bào)錯(cuò)下載失敗，推測(cè)原因?yàn)榫W(wǎng)絡(luò)/網(wǎng)速問題。春節(jié)在家，無法更換網(wǎng)絡(luò)，故嘗試在不同時(shí)間段進(jìn)行下載，最后終于成功。另外，發(fā)...
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gdc-client下載與安裝配置下載軟件地址：https://gdc.cancer.gov/access-data/gdc-data-transfer-tool[https://gdc.cancer.gov...
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R-函數(shù)do.call()使用
x <- data.frame(matrix(1:6, ncol = 6), matrix(6:66, ncol = 5), matrix(18:46, ncol=5)...
