個(gè)人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪(fǎng)問(wèn))
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hyphy計(jì)算選擇壓力(+pal2nal的使用)
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有沒(méi)有興趣拉個(gè)討論組，交流著學(xué)，我正在整理一份比較基因組教程https://blog.csdn.net/shuai19970911/article/details/136898828?spm=1001.2014.3001.5502
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@就是大餅 在生成的文件的好幾百行以后，才發(fā)現(xiàn)了蛋白字符：-----------------------------------------MA-SEAHDD----------
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@就是大餅 可是這樣運(yùn)行mafft后，比對(duì)結(jié)果發(fā)現(xiàn)結(jié)果文件幾乎是空的，全是----橫線(xiàn)，每個(gè)箭頭后面代表的是一個(gè)基因的名字。大佬可以留個(gè)郵件或者聯(lián)系方式指點(diǎn)一下嗎. mafft --auto --thread 20 input_pep.fasta > test.pep.aln 這是我的命令，運(yùn)行了三天。>rna-gnl|WGS:WBNA|NOTNIG_R07202_mrna
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------------------------------------------------------------ 這是結(jié)果文件前幾行hyphy計(jì)算選擇壓力(+pal2nal的使用)
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請(qǐng)問(wèn)將每個(gè)物種的蛋白序列和CSD序列取出來(lái)后是直接cat合并成一個(gè)文件嗎
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Deeplabcut報(bào)錯(cuò)筆記
問(wèn)題：Cannot load backend 'WXAgg' which requires the 'wx' interactive framework, as 'qt' i...
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群體遺傳學(xué)習(xí)筆記-基礎(chǔ)知識(shí)
群體遺傳學(xué)介紹 傳統(tǒng)群體遺傳學(xué)是基于觀(guān)察到的等位基因頻率與預(yù)期頻率的分析。例如，在Wright-Fisher模型下，你可能會(huì)看到有性繁殖的二倍體個(gè)體群體，而且這些種群沒(méi)有重疊...
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Python語(yǔ)言基礎(chǔ)之——異常和正則
1.異常捕獲 1.什么是異常捕獲： 讓程序執(zhí)行過(guò)程中出現(xiàn)異常的時(shí)候不崩潰可以繼續(xù)進(jìn)行注意：不是任何時(shí)候都要只用異常捕獲，是在你明明知道某個(gè)位置可能會(huì)出現(xiàn)異常，但是又不想讓程序...
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Python語(yǔ)言基礎(chǔ)之——文件操作
1. 文件操作 1.計(jì)算機(jī)數(shù)據(jù)的存儲(chǔ) 計(jì)算機(jī)的存儲(chǔ)系統(tǒng)分為運(yùn)行內(nèi)存和硬盤(pán)兩種運(yùn)行內(nèi)存：用來(lái)保存程序運(yùn)行過(guò)程中產(chǎn)生的數(shù)據(jù)，程序運(yùn)行結(jié)束后會(huì)自動(dòng)銷(xiāo)毀硬盤(pán) ：用來(lái)保存文件，保存...
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Python語(yǔ)言基礎(chǔ)之——迭代器生成器和模塊
1.迭代器 1.什么是迭代器（iter） 迭代器是容器型數(shù)據(jù)類(lèi)型，只能通過(guò)類(lèi)型轉(zhuǎn)換和生成器來(lái)獲得迭代器對(duì)象迭代器存儲(chǔ)數(shù)據(jù)的特點(diǎn)：同時(shí)可以保存多個(gè)數(shù)據(jù)，沒(méi)有辦法直接查看，而是需...
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Python語(yǔ)言基礎(chǔ)之——三大神器
1.高階函數(shù) 1.函數(shù)就是變量 函數(shù)就是變量，函數(shù)名就是變量名 2.高階函數(shù) 變量可以作為函數(shù)參數(shù) 實(shí)參高階函數(shù)： 系統(tǒng)提供的常見(jiàn)的實(shí)參高階函數(shù)： 1.max、min、sor...
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Python語(yǔ)言基礎(chǔ)之——函數(shù)進(jìn)階
1.函數(shù)的返回值 1.什么是返回值 返回值是函數(shù)從函數(shù)里面?zhèn)鬟f到函數(shù)外面的數(shù)據(jù)1）怎么返回返回值就是return關(guān)鍵字后面的表達(dá)式的值語(yǔ)法： return 表達(dá)式1,表達(dá)式2...
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Python語(yǔ)言基礎(chǔ)之——字符串和函數(shù)基礎(chǔ)
1.字符串相關(guān)方法 1.計(jì)算次數(shù) 1.count 字符串1.count(字符串2) - 統(tǒng)計(jì)字符串1中字符串2出現(xiàn)的次數(shù) 字符串1.count(字符串2, 開(kāi)始下...
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Python語(yǔ)言基礎(chǔ)之——字符串
1.字符串和字符 1.什么是字符串(str) 1.字符串是容器型數(shù)據(jù)類(lèi)型，將單引號(hào)或者雙引號(hào)作為容器的標(biāo)志，元素之間不需要用逗號(hào)(,)隔開(kāi)：'元素1元素2元素3'2.字符串是...
