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  • ‘NSBS’ for signature 'SortedByQueryHits'

    兩種原因,ChIPseeker會(huì)出現(xiàn)如下報(bào)錯(cuò) ‘unable to find an inherited method for function...

  • 植物測(cè)序數(shù)據(jù)rRNA污染清理

    由于實(shí)驗(yàn)技術(shù)或操作原因,有些高通量測(cè)序數(shù)據(jù)中存在大量的rRNA污染,評(píng)估和去除rRNA是后續(xù)分析的基礎(chǔ)。 首先 到核糖體RNA數(shù)據(jù)庫(kù) silva...

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    從零開(kāi)始學(xué)習(xí)circos(一)

    circos是基因組學(xué)最經(jīng)常使用的圖之一,軟件按照調(diào)試已經(jīng)完成了,相對(duì)簡(jiǎn)單。circos最繁盛的地方是學(xué)習(xí)conf文件配置,下面從零開(kāi)始記錄ci...

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    maSigPro 處理時(shí)間序列轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)

    時(shí)間序列研究的是基因表達(dá)的動(dòng)態(tài)行為,測(cè)量的是一系列和時(shí)間點(diǎn)之間有強(qiáng)烈相關(guān)性的過(guò)程。和針對(duì)某一時(shí)間點(diǎn)的基因表達(dá)進(jìn)行差異分析不同,時(shí)間序列更加關(guān)注是...

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  • MethylKit 使用手冊(cè)

    methylKit是一個(gè)用于分析DNA甲基化測(cè)序數(shù)據(jù)的R包,其核心功能是差異甲基化分析和差異甲基化位點(diǎn)/區(qū)域的注釋。 1. 加載原始數(shù)據(jù) DNA...

  • 使用ImpluseDE2處理轉(zhuǎn)錄組時(shí)間序列數(shù)據(jù)

    ImpulseDE2 是一個(gè)處理時(shí)序數(shù)據(jù)的R包,用于查找時(shí)序數(shù)據(jù)的差異基因,它可以用來(lái)解決兩類(lèi)問(wèn)題。 Case-only differentia...

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    WGCNA 挑選軟閾值

    我們今天就搞清楚這兩個(gè)問(wèn)題:1.什么是無(wú)尺度分布2.手工計(jì)算軟閾值 無(wú)尺度分布 假如我問(wèn)大家,如果你想認(rèn)識(shí)世界上的任何一個(gè)人,需要通過(guò)幾個(gè)人來(lái)聯(lián)...

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    在NCBI建立BioProject及數(shù)據(jù)上傳

    1、創(chuàng)建自己的NCBI賬號(hào) 過(guò)程,略 2、創(chuàng)建BioProject 1、進(jìn)入BioProject 2、選擇Submission 3、創(chuàng)建new ...

  • numpy安裝成功后 依然顯示 no module named numpy

    今天在運(yùn)行某個(gè)軟件時(shí),提示numpy版本過(guò)低,于是用之前的方法安裝了新的numpy 結(jié)果出現(xiàn)標(biāo)題的報(bào)錯(cuò) 檢測(cè)后發(fā)現(xiàn)是conda將numpy裝在了...

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