前幾天學習了文獻CUT&Tag[http://www.itdecent.cn/p/335aec753039]，了解了原理以后，可以跟著官網(wǎng)來學習如何分析CUT&Tag數(shù)據(jù)了...
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CUT&Tag數(shù)據(jù)分析筆記（1） -
NATURE:組蛋白變體在調(diào)節(jié)染色質(zhì)組織和功能中的作用
牛年第一篇文獻閱讀筆記~這是一篇發(fā)表在2020年9月份Nature上的綜述。文獻的題目是：The roles of histone variants in fine- tun...
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RNA-seq(6): reads計數(shù)，合并矩陣并進行注釋任務(wù) 1.實現(xiàn)這個功能的軟件也很多，還是煩請大家先自己搜索幾個教程，入門請統(tǒng)一用htseq-count，對每個樣本都會輸出一個表達量文件。2.需要用腳本合并所有的樣本為表達矩...
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亞細胞定位的愛恨情仇：核、質(zhì)之爭一、背景介紹 亞細胞結(jié)構(gòu)簡介 ??1974年，阿爾伯特·克勞德（Albert Claude）因其在細胞結(jié)構(gòu)和亞細胞結(jié)構(gòu)上的研究和發(fā)現(xiàn)獲得諾貝爾獎。亞細胞結(jié)構(gòu)，是比細胞結(jié)構(gòu)更細...
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WGCNA學習：WGCNA應(yīng)用場景與實例解讀WGCNA筆記第二彈 WGCNA分析原理 WGCNA應(yīng)用場景 WGCNA分析實踐 1.WGCNA應(yīng)用場景 不同組織樣品 時間序列樣品：生長發(fā)育，脅迫處理 單個材料：相同處理不...
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WGCNA學習：WGCNA分析原理本教程根據(jù)PlantTech的WGCNA課程編寫，課程還是不錯的，所以將該課程給大家分享一下。 WGCNA筆記第一彈 WGCNA分析原理 WGCNA應(yīng)用場景 WGCNA分析實...
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重畫《癌生物學》插圖||原發(fā)癌和它們的轉(zhuǎn)移傾向在讀《癌生物學》第十四章：<遷出：侵襲和轉(zhuǎn)移>的時候看到一張插圖（圖14.43）： 看到箭頭就想到網(wǎng)絡(luò)圖的我，不免想起用igraph來畫一下這個插圖。 于是，我開始量化這幾個...
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植物RNA-seq (Salmon)從軟件安裝到下游分析(純Mac) 4.8更完寫在前面： 整個流程是首次從軟件安裝-數(shù)據(jù)下載-上游分析-下游分析。代碼沒毛病，奇怪的是salmon比對后，mapping～15%（不正常），一般來說期望mapping應(yīng)該是...
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1.轉(zhuǎn)錄組 | 上游分析（數(shù)據(jù)下載，比對，計數(shù)）參考：轉(zhuǎn)錄組分析記錄； 轉(zhuǎn)錄組入門和進階以下內(nèi)容為轉(zhuǎn)錄組全部的上游分析，包括下載數(shù)據(jù)、比對、計數(shù)得到表達矩陣。https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo...
