本文共分3部分。 首先介紹一下copyKAT原理和使用方法。然后提出一個(gè)關(guān)于細(xì)胞過(guò)濾的問(wèn)題。最后提出一個(gè)解決問(wèn)題的方法供參考。 1.copyKAT及使用簡(jiǎn)介 copyKAT是...
IP屬地：上海
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用copyKAT推斷腫瘤細(xì)胞CNV及解決細(xì)胞過(guò)濾問(wèn)題 -
CNS圖表復(fù)現(xiàn)16—inferCNV結(jié)果解讀及利用
本文是參考學(xué)習(xí)CNS圖表復(fù)現(xiàn)16—inferCNV結(jié)果解讀及利用[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI1Njk4ODE0MQ==&mid=...
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讀《T-Cell Differentiation》||免疫細(xì)胞の名門望族知道這本書是一個(gè)偶然的機(jī)會(huì)，那段時(shí)間正好在研究免疫細(xì)胞比較厲害的團(tuán)隊(duì)工作（忝列門墻?。?，自然想找點(diǎn)資料來(lái)擴(kuò)充一下自己的知識(shí)面，以便知道T細(xì)胞到底有幾個(gè)正宗的亞群。如張老師對(duì)T...
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單細(xì)胞交響樂(lè)1-理解scRNA常用的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)SingleCellExperiment劉小澤寫于19.10.26-27，更新于2020-06-23，最近會(huì)繼續(xù)整理這本資料為何取名叫“交響樂(lè)”？因?yàn)閱渭?xì)胞分析就像一個(gè)大樂(lè)團(tuán)，需要各個(gè)流程的協(xié)同配合分析單細(xì)胞數(shù)據(jù)，...
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Week25 — 人類原發(fā)性腫瘤的染色質(zhì)可及性圖譜-02Week24 — 人類原發(fā)性腫瘤的染色質(zhì)可及性圖譜-01上篇文章首先回顧了ATAC-seq方法的原理和優(yōu)點(diǎn)，以及與其他研究染色質(zhì)可及性方法的比較，然后介紹了這篇文章的主要結(jié)果...
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好家伙，到底誰(shuí)在用TBtools寫在前面 之前寫了publish or perish的使用方法。那么問(wèn)題來(lái)了，我們獲取了這些數(shù)據(jù)能拿來(lái)干什么？于是萌生了一個(gè)想法，不如統(tǒng)計(jì)一下引用TBtools的文章，統(tǒng)計(jì)一...
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【單細(xì)胞】SingleR注釋細(xì)胞類型
SingleR 教程網(wǎng)址（https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/SingleR/inst/...
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Day 1 ——菠蘿“眼前的難題還無(wú)法破解，不存在作業(yè)和憂傷”——《我不想寫作業(yè)》 這是預(yù)覽模式 最大的標(biāo)題 一級(jí) 二級(jí)標(biāo)題 三級(jí)標(biāo)題 四級(jí)標(biāo)題 最小的標(biāo)題 六級(jí) 無(wú)序列表 文本1文本2（2個(gè)...
