在單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析中，在確定細(xì)胞類型后，除了可以進(jìn)行差異表達(dá)基因分析外，還可以針對(duì)單個(gè)細(xì)胞類型進(jìn)行分析特定分析，這時(shí)就需要我們提取細(xì)胞子集分開(kāi)處理了。 一、Seurat數(shù)據(jù)格式...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：貴州
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Seurat取子集時(shí)會(huì)用到的函數(shù)和方法 -
免疫組庫(kù)系列-R包DivE的使用
中文應(yīng)該只有我寫(xiě)了這個(gè)。。 “ DivE”估計(jì)量是一種啟發(fā)式方法，用于估計(jì)種群中的種類數(shù)量或物種數(shù)量(物種豐富度)。 文章 Quantification of HTLV-1 ...
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論文日鑒0-一些方法和代碼
隨緣記錄自己看到的一些文章文獻(xiàn)以及一些工具，又因?yàn)橹饕獌?nèi)容和生信可能比較相關(guān)，寫(xiě)作隨緣，更新隨緣，故名緣信,過(guò)去的一周為第47周，為本刊第一周 文章 Temporal Dyn...
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Linux的parallel并行方法
我對(duì)于parallel并行的簡(jiǎn)單理解即同時(shí)執(zhí)行多個(gè)命令語(yǔ)句。它與For循環(huán)語(yǔ)句的逐條運(yùn)行的思路大相徑庭。盡管目前很多生信軟件支持多線程運(yùn)行(一條命令語(yǔ)句內(nèi))，但并不是設(shè)置的越...
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找基因所在的通路新的任務(wù)，找到這 276 genes encompassed nine major DDR pathways:base excision repair (BER),nucle...
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DALS017-高維數(shù)據(jù)推斷2-統(tǒng)計(jì)原理
title: DALS017-高維數(shù)據(jù)推斷2-統(tǒng)計(jì)原理date: 2019-08-17 12:0:00type: "tags"tags: 高維數(shù)據(jù)categories: Da...
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OSCA單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析筆記-13、Multi-sample comparison對(duì)應(yīng)原版教程第14章http://bioconductor.org/books/release/OSCA/overview.html[http://bioconductor....
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使用cytoscape 將數(shù)據(jù)可視化處理將TCMSP 數(shù)據(jù)庫(kù)信息匹配uniprot 通過(guò)上述操作，可以得到藥物對(duì)應(yīng)基因的信息。 借助cytospace 可以做很多事情 比如做一個(gè)美妙的網(wǎng)絡(luò)可視化圖 準(zhǔn)備數(shù)據(jù) net...
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簡(jiǎn)書(shū)筆記匯總
以下是我簡(jiǎn)書(shū)里所有的文章鏈接，按不同的專題分類，方便大家根據(jù)不同專題以及文章題目快速的查看所需內(nèi)容。 持續(xù)更新中~ Linux學(xué)習(xí)筆記 《Linux命令行與shell腳本編程...
