在群體遺傳學(xué)研究中，LD連鎖不平衡分析是最常見的分析內(nèi)容，也是關(guān)聯(lián)分析的基礎(chǔ)。如何正確理解并且進(jìn)行相關(guān)的LD連鎖不平衡分析是群體遺傳中很基本的一件事情。下面和大家一起學(xué)習(xí)一下...
IP屬地：俄勒岡州
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LD衰減圖的理解與應(yīng)用
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用excel操作序列（引物設(shè)計）介紹 最早是我讀研究生一年級時，用VBA處理過一些DNA序列處理（word）、繪制圖片（Powerpoint），也寫過幾個excel函數(shù)用于DNA oligo的基本分析和操作...
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高通量測序數(shù)據(jù)處理學(xué)習(xí)記錄（三）：Pathway Analysis及GSEAPathway Analysis討論及基因富集分析軟件（Gene Set Enrichment Analysis，GSEA）使用實戰(zhàn) 在所有物是人非的景色里，我最中意你。 背...
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質(zhì)粒系列之再談無縫連接--Gibson assembly
我們用兩篇文章的篇幅大概講了一遍質(zhì)粒骨架及其各個要素的介紹：解剖式學(xué)習(xí)一個質(zhì)粒結(jié)構(gòu)--update[http://www.itdecent.cn/p/e6c5852f60c...
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轉(zhuǎn)錄組分析5——差異表達(dá)分析差異表達(dá)分析內(nèi)容：? 基因表達(dá)量的標(biāo)準(zhǔn)化方法及可視化? counts，RPKM，F(xiàn)PKM，TPM? PCA圖、熱圖等? 差異表達(dá)分析及可視化? limma-voom，edge...
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R數(shù)據(jù)可視化17:?；鶊D感覺100年沒有上簡書，近2個月忙于畢業(yè)論文以及公眾號推文，沒有時間更文章。終于前幾天交了論文呢，可以回來更文了。沒錯我只是在為我的懶惰尋找接口，今天我們來講一下?；鶊D（Sa...
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R 數(shù)據(jù)科學(xué)（十五）—summarize函數(shù)+group_by函數(shù)記住是summarize函數(shù)而不是summarise函數(shù) summarize函數(shù)可以進(jìn)數(shù)據(jù)框折疊成一行 計數(shù)本質(zhì)上返回的是分組后的行數(shù) group_by為分組函數(shù)，是如果我們...
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標(biāo)準(zhǔn)差與標(biāo)準(zhǔn)誤
標(biāo)準(zhǔn)差 在統(tǒng)計中，標(biāo)準(zhǔn)差是一種用于量化一組數(shù)據(jù)值的變化或分散程度的度量。一個較大的標(biāo)準(zhǔn)差，代表大部分?jǐn)?shù)值和其平均值之間差異較大；一個較小的標(biāo)準(zhǔn)差，代表這些數(shù)值較接近平均值。 ...
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panel.spacing解決了我許久的強(qiáng)迫癥一直以來畫分面圖都有一個小小的缺陷，如圖1所示不能消除分面之間的間距，今天終于發(fā)現(xiàn)原來可以通過panel.spacing函數(shù)來調(diào)整間距，強(qiáng)迫癥終于得到了滿足
