主要根據(jù)文獻(xiàn)中的描述與方法 髓系細(xì)胞分類 巨噬細(xì)胞,單核細(xì)胞,DC細(xì)胞 文獻(xiàn)一:Single-cell landscape of the ecosystem in early...
主要根據(jù)文獻(xiàn)中的描述與方法 髓系細(xì)胞分類 巨噬細(xì)胞,單核細(xì)胞,DC細(xì)胞 文獻(xiàn)一:Single-cell landscape of the ecosystem in early...
TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)疾病縮寫 ACCAdrenocortical carcinoma腎上腺皮質(zhì)癌BLCABladder Urothelial Carcinoma膀胱尿路上皮癌BRC...
這是我聽B站鯪魚不會(huì)飛視頻(GO,KEGG,DO富集分析)里的筆記哦~當(dāng)然有的地方加上的是我自己的理解,如果哪里和視頻上講的不一樣那是我自己發(fā)揮的,自行忽略.... 市面上公...
一文了解單細(xì)胞對(duì)象數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)/數(shù)據(jù)格式,單細(xì)胞數(shù)據(jù)操作不迷茫。本文內(nèi)容包括 單細(xì)胞seurat對(duì)象數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu), 內(nèi)容構(gòu)成,對(duì)象的調(diào)用、操作,常見函數(shù)的應(yīng)用等。 1. 單細(xì)胞seu...
Error: install.packages failed to lock directory 在使用bioconductor安裝一些包的時(shí)候,比如我安裝GEOquery時(shí)...
劉小澤寫于2020.5.18上次看了熱圖如何去掉聚類樹的同時(shí)保留聚類的順序 ,有朋友留言給出了其他的解決方法,非常感謝!文中會(huì)給出答案另外,這次還是帶著數(shù)據(jù),去看看pheat...
單細(xì)胞分析不可避免的會(huì)涉及到鑒定不同細(xì)胞類型的功能或比較相同類型在不同狀態(tài)下的功能差異,因此,功能分析在單細(xì)胞分析中相當(dāng)重要. 功能分析的方法很多,這兒我們主要講述3種功能分...
單細(xì)胞GSEA分析需要的文件有兩個(gè):1. 單細(xì)胞基因表達(dá)變化數(shù)據(jù)(兩列,一列是geneid/gene symbol,一列是logFC)(文件格式:.rnk)2. 目標(biāo)基因集(...
單細(xì)胞富集分析系列: 單細(xì)胞之富集分析-1:?jiǎn)渭?xì)胞GSEA分析流程[http://www.itdecent.cn/p/00f069cb239c] 1. 背景 Gene Se...