寫(xiě)在前面 其實(shí)很多作者已經(jīng)探索的差不多了,相關(guān)腳本、教程也很多,但我還是自己系統(tǒng)的總結(jié)一下吧。有時(shí)候感覺(jué)是浪費(fèi)時(shí)間,但是在寫(xiě)的時(shí)候能發(fā)現(xiàn)并學(xué)習(xí)到很多新的知識(shí),不斷記錄反思,也...
寫(xiě)在前面 其實(shí)很多作者已經(jīng)探索的差不多了,相關(guān)腳本、教程也很多,但我還是自己系統(tǒng)的總結(jié)一下吧。有時(shí)候感覺(jué)是浪費(fèi)時(shí)間,但是在寫(xiě)的時(shí)候能發(fā)現(xiàn)并學(xué)習(xí)到很多新的知識(shí),不斷記錄反思,也...
|本文首發(fā)于“生信補(bǔ)給站”公眾號(hào),https://mp.weixin.qq.com/s/04FA3O4QVwg9CNtHBWbUYw[https://mp.weixin.qq...
眾所周知,seurat在降維之后主要依據(jù)兩個(gè)函數(shù)來(lái)進(jìn)行細(xì)胞分類(lèi),這里我們來(lái)深入了解一下seurat如何進(jìn)行細(xì)胞分類(lèi)的。首先我們來(lái)看有關(guān)分類(lèi)的兩個(gè)函數(shù) 我們來(lái)一一解決其中的問(wèn)題...
單細(xì)胞測(cè)序有著漫長(zhǎng)的過(guò)去,卻只有短暫的歷史---誰(shuí)說(shuō)的! 說(shuō)她漫長(zhǎng)是因?yàn)榈饺缃褚灿惺畮啄甑臍v史了,說(shuō)她段短暫是因?yàn)獒槍?duì)單細(xì)胞的分析工具越來(lái)越有意義開(kāi)發(fā)周期卻越來(lái)越短。一般生物...
| 本文首發(fā)于“生信補(bǔ)給站” https://mp.weixin.qq.com/s/tQt0ezYJj3H7x3aWZmKVEQ 一 summarise 匯總 匯總函數(shù) su...
XGBoost使用 原始數(shù)據(jù) 數(shù)據(jù)介紹 鳶尾花數(shù)據(jù)集是由杰出的統(tǒng)計(jì)學(xué)家R.A.Fisher在20世紀(jì)30年代中期創(chuàng)建的,它被公認(rèn)為用于數(shù)據(jù)挖掘的最著名的數(shù)據(jù)集。它包含3種植物...
@沙卡巴卡 哦哦……抱歉,那時(shí)候還不會(huì)……后面的推文就是MD寫(xiě)的了??
pheatmap|暴雨暫歇,“熱圖”來(lái)襲?。?!熱圖可以聚合大量的數(shù)據(jù),并可以用一種漸進(jìn)色來(lái)優(yōu)雅地表現(xiàn),可以很直觀地展現(xiàn)數(shù)據(jù)的疏密程度或頻率高低。 本文利用R語(yǔ)言pheatmap包從頭開(kāi)始繪制各種漂亮的熱圖。參數(shù)像積木,拼...
本文首發(fā)于“生信補(bǔ)給站”,https://mp.weixin.qq.com/s/Gl6BChxSYbSHMo9oMpufPg 連鎖不平衡圖,用來(lái)可視化不同SNP之間的連鎖程度...
本文首發(fā)于“生信補(bǔ)給站”,https://mp.weixin.qq.com/s/_rTWJHcbUu2Eqtex74gUBA 散點(diǎn)圖繪制回歸曲線(xiàn)很常用,那么添加上回歸方程,P...