寫(xiě)在前面 其實(shí)很多作者已經(jīng)探索的差不多了，相關(guān)腳本、教程也很多，但我還是自己系統(tǒng)的總結(jié)一下吧。有時(shí)候感覺(jué)是浪費(fèi)時(shí)間，但是在寫(xiě)的時(shí)候能發(fā)現(xiàn)并學(xué)習(xí)到很多新的知識(shí)，不斷記錄反思，也...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：北京
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生信 | ATAC-Seq基礎(chǔ)分析+高級(jí)分析+多組學(xué)分析 -
funkyheatmap |臨床+組學(xué)+分組數(shù)據(jù)可視化“神器”，時(shí)髦的熱圖
|本文首發(fā)于“生信補(bǔ)給站”公眾號(hào)，https://mp.weixin.qq.com/s/04FA3O4QVwg9CNtHBWbUYw[https://mp.weixin.qq...
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這個(gè)世界流行離開(kāi)，但我們卻不擅長(zhǎng)告別
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Seurat識(shí)別細(xì)胞類(lèi)群的原理（FindNeighbors和FindClusters）眾所周知，seurat在降維之后主要依據(jù)兩個(gè)函數(shù)來(lái)進(jìn)行細(xì)胞分類(lèi)，這里我們來(lái)深入了解一下seurat如何進(jìn)行細(xì)胞分類(lèi)的。首先我們來(lái)看有關(guān)分類(lèi)的兩個(gè)函數(shù) 我們來(lái)一一解決其中的問(wèn)題...
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10X單細(xì)胞測(cè)序分析軟件:Cell ranger單細(xì)胞測(cè)序有著漫長(zhǎng)的過(guò)去，卻只有短暫的歷史---誰(shuí)說(shuō)的！ 說(shuō)她漫長(zhǎng)是因?yàn)榈饺缃褚灿惺畮啄甑臍v史了，說(shuō)她段短暫是因?yàn)獒槍?duì)單細(xì)胞的分析工具越來(lái)越有意義開(kāi)發(fā)周期卻越來(lái)越短。一般生物...
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心有明月，諸事無(wú)悔。愿執(zhí)螢火，仰望星空。已轉(zhuǎn)生活號(hào)。
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中山大學(xué)中山醫(yī)學(xué)院-基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)博士在讀<br>歡迎關(guān)注個(gè)人公眾號(hào)<br><br>公眾號(hào)：bioinfomics<br>博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fdongwei1220.github.io%2F" target="_blank">https://dongwei1220.github.io/</a><br>
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tidyverse|數(shù)據(jù)分析常規(guī)操作-分組匯總（sumamrise+group_by)
| 本文首發(fā)于“生信補(bǔ)給站” https://mp.weixin.qq.com/s/tQt0ezYJj3H7x3aWZmKVEQ 一 summarise 匯總 匯總函數(shù) su...
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xgboost初識(shí)XGBoost使用 原始數(shù)據(jù) 數(shù)據(jù)介紹 鳶尾花數(shù)據(jù)集是由杰出的統(tǒng)計(jì)學(xué)家R.A.Fisher在20世紀(jì)30年代中期創(chuàng)建的，它被公認(rèn)為用于數(shù)據(jù)挖掘的最著名的數(shù)據(jù)集。它包含3種植物...
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@沙卡巴卡 哦哦……抱歉，那時(shí)候還不會(huì)……后面的推文就是MD寫(xiě)的了??
pheatmap|暴雨暫歇，“熱圖”來(lái)襲?。?！
熱圖可以聚合大量的數(shù)據(jù)，并可以用一種漸進(jìn)色來(lái)優(yōu)雅地表現(xiàn)，可以很直觀地展現(xiàn)數(shù)據(jù)的疏密程度或頻率高低。 本文利用R語(yǔ)言pheatmap包從頭開(kāi)始繪制各種漂亮的熱圖。參數(shù)像積木，拼...
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LDheatmap | SNP連鎖不平衡圖（LD）可視化，自己數(shù)據(jù)實(shí)現(xiàn)版！
本文首發(fā)于“生信補(bǔ)給站”，https://mp.weixin.qq.com/s/Gl6BChxSYbSHMo9oMpufPg 連鎖不平衡圖，用來(lái)可視化不同SNP之間的連鎖程度...
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R-ggpmisc|回歸曲線(xiàn)添加回歸方程，R2，方差表，香不香？
本文首發(fā)于“生信補(bǔ)給站”，https://mp.weixin.qq.com/s/_rTWJHcbUu2Eqtex74gUBA 散點(diǎn)圖繪制回歸曲線(xiàn)很常用，那么添加上回歸方程，P...
