----前不久拿到公司給的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果，Gene ID是以ENMUST開(kāi)頭，查了一下，ENST為EMBL 核酸數(shù)據(jù)庫(kù)中人類(lèi)的轉(zhuǎn)錄本ID，ENMUST為鼠的轉(zhuǎn)錄本ID。一般我...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：河南
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Transcript ID（ENST/ENSMUST/NM_123456）轉(zhuǎn)換為gene ID（ENSG/ENSMUSG/Gene ID）和Gene name/Symbol -
如何根據(jù)染色體坐標(biāo)批量提取對(duì)應(yīng)的DNA序列（bedtools）
這一篇小筆記是在我處理自己的數(shù)據(jù)的時(shí)候遇到的問(wèn)題，經(jīng)過(guò)查閱資料解決了，故記錄下來(lái)。 比如現(xiàn)在：你需查找一段序列，比如說(shuō)小鼠的chr10:105280000-105280550...
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2021-04-30 可變剪接與rMATS分析可變剪接(Alternative splicing)：一個(gè)基因的外顯子以不同的組合方式剪接形成不同的成熟RNA，由此產(chǎn)生的不同的 mRNA 可能被翻譯成不同的蛋白質(zhì)構(gòu)體，因此...
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【不定期更新】Bedtools大全--42個(gè)子命令介紹參考鏈接： 用法大全: 官方說(shuō)明：https://bedtools.readthedocs.io/en/latest/content/overview.htmlBedtool...
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【R語(yǔ)言】factoextra生成發(fā)表級(jí)PCA主成分分析圖（一）前面給大家介紹過(guò)主成分分析 ?R做PCA主成分分析[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixin.qq.com/s%3F...
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【ChIP-seq 實(shí)戰(zhàn)】六、使用macs2找peaks
這里是佳奧！ ChIP-Seq分析進(jìn)入關(guān)鍵步驟。讓我們開(kāi)始吧！ macs2包含一系列的子命令，其中最主要的就是callpeak， 官方提供了使用實(shí)例 介紹一下各個(gè)參數(shù)的意義：...
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Homer預(yù)測(cè)共表達(dá)基因的motifHomer這個(gè)軟件比較強(qiáng)大，主要做ChIP-Seq分析，除此之外，還可以做RNAseq以及microarray的分析，并且還可以計(jì)算共表達(dá)基因中的motif。 原文： Ana...
