----前不久拿到公司給的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果,Gene ID是以ENMUST開(kāi)頭,查了一下,ENST為EMBL 核酸數(shù)據(jù)庫(kù)中人類(lèi)的轉(zhuǎn)錄本ID,ENMUST為鼠的轉(zhuǎn)錄本ID。一般我...
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這一篇小筆記是在我處理自己的數(shù)據(jù)的時(shí)候遇到的問(wèn)題,經(jīng)過(guò)查閱資料解決了,故記錄下來(lái)。 比如現(xiàn)在:你需查找一段序列,比如說(shuō)小鼠的chr10:105280000-105280550...
可變剪接(Alternative splicing):一個(gè)基因的外顯子以不同的組合方式剪接形成不同的成熟RNA,由此產(chǎn)生的不同的 mRNA 可能被翻譯成不同的蛋白質(zhì)構(gòu)體,因此...
參考鏈接: 用法大全: 官方說(shuō)明:https://bedtools.readthedocs.io/en/latest/content/overview.htmlBedtool...
前面給大家介紹過(guò)主成分分析 ?R做PCA主成分分析[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixin.qq.com/s%3F...
這里是佳奧! ChIP-Seq分析進(jìn)入關(guān)鍵步驟。讓我們開(kāi)始吧! macs2包含一系列的子命令,其中最主要的就是callpeak, 官方提供了使用實(shí)例 介紹一下各個(gè)參數(shù)的意義:...
Homer這個(gè)軟件比較強(qiáng)大,主要做ChIP-Seq分析,除此之外,還可以做RNAseq以及microarray的分析,并且還可以計(jì)算共表達(dá)基因中的motif。 原文: Ana...